RNA–Protein interactions for RNA: YJR136C

TTI2, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI2, Length 1,266 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI2	YJR136C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	CLC1	P17891	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	REC107	P21651	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	MBR1	P23493	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	CCT6	P39079	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ALG5	P40350	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	IRC8	P47046	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	JJJ1	P53863	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	MDG1	P53885	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	EFM6	P53970	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	BUD7	Q08754	746 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	GRX6	Q12438	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	NUP1	P20676	1076 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RPC53	P25441	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	GSH1	P32477	678 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	CST26	P38226	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	FTH1	P38310	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SMF1	P38925	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SAE2	P46946	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ORC5	P50874	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	TWF1	P53250	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ATP23	P53722	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	VPS9	P54787	451 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	MAK10	Q02197	733 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ATG29	Q12092	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RAP1	P11938	827 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	CMC1	P36064	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	YEL057C	P39983	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	PTR3	P43606	678 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	LCL3	P53153	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RCF1	Q03713	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	GRC3	Q07845	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ISA2	Q12425	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SEC39	Q12745	709 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	PET111	P08468	800 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	PTP1	P25044	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	BOS1	P25385	244 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	MRE11	P32829	692 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	YBR144C	P34215	104 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	ICS2	P38284	255 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	ELO1	P39540	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	YJL068C	P40363	299 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	SNO3	P43544	222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	YFR020W	P43600	232 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	NMD5	P46970	1048 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	RMT2	Q03305	412 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	CDC45	Q08032	650 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	ATG9	Q12142	997 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	GAL80	P04387	435 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	MAK32	P23060	363 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	IMG1	P25626	169 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	GPI10	P30777	616 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	SYN8	P31377	255 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	DBP8	P38719	431 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	DOT5	P40553	215 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	SSU1	P41930	458 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	RSC1	P53236	928 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	PFA5	Q03289	374 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	ARG81	P05085	880 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	HOM3	P10869	527 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	MDM10	P18409	493 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	OCT1	P35999	772 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	TSC10	P38342	320 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	PET130	P47065	347 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	UBP8	P50102	471 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	YPR003C	P53394	754 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	CIK1	Q01649	594 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TTI2	YJR136C	VTA1	Q06263	330 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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