RNA–Protein interactions for RNA: YJL172W

CPS1, Transcript of Vacuolar carboxypeptidase S, yeast

Gene CPS1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPS1	YJL172W	RCN1	P36054	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YKL069W	P36088	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	VRP1	P37370	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SSO2	P39926	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	UBP5	P39944	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SPO74	P45819	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	TAF4	P50105	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	COS6	P53344	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	GTB1	Q04924	702 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	PDR8	Q06149	701 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SHS1	Q07657	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SIL1	Q08199	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	RTR2	Q12378	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SPO21	Q12411	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	PCD1	Q12524	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	ECM29	P38737	1868 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SPO12	P17123	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	ADY2	P25613	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CPS1	YJL172W	VPS17	P32913	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	TRM2	P33753	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	DRE2	P36152	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	FRT2	P39734	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	FIR1	P40020	876 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	VFA1	P40080	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SAD1	P43589	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YJR054W	P47114	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	RFX1	P48743	811 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	MRM2	P53123	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SAM50	P53969	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	REH1	Q06709	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	GRS2	Q06817	618 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	HMS1	Q12398	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	ARP7	Q12406	477 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	MET3	P08536	511 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SEC63	P14906	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	IDI1	P15496	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	HMX1	P32339	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	HXT1	P32465	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	ORC2	P32833	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	SMC1	P32908	1225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	GIP1	P38229	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	TVP23	P38962	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	QDR1	P40475	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	FAR7	P43592	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YML6	P51998	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	CGR1	P53188	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	REC102	Q02721	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	URH1	Q04179	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	MLC2	Q06580	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	UIP4	Q08926	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	MED2	Q12124	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPS1	YJL172W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	SPO16	P17122	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	GLN3	P18494	730 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	PRR1	P28708	518 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	AST1	P35183	429 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	PHO11	P35842	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	RDH54	P38086	958 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	POA1	P38218	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	PHO12	P38693	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	MSC7	P38694	644 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	YHL026C	P38740	315 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPS1	YJL172W	RAD55	P38953	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.5 ms