RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	NUP100	Q02629	959 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	PIR3	Q03180	325 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	UIP4	Q08926	304 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	MDY2	Q12285	212 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MAS1	P10507	462 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SDH2	P21801	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SAN1	P22470	610 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YSP3	P25036	478 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RAD27	P26793	382 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ACH1	P32316	526 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RCN1	P36054	211 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YBR138C	P38277	524 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RGI2	P40188	164 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PRM2	P40534	656 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	FMP32	P43557	207 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YTP1	P53584	459 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ORC3	P54790	616 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SPP2	Q02521	185 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NHP10	Q03435	203 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HER2	Q03557	464 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CRN1	Q06440	651 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MCH5	Q08777	521 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HEM2	P05373	342 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ABF1	P14164	731 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ATP7	P30902	174 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CTF13	P35203	478 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	VRP1	P37370	817 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GIP1	P38229	639 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	COA1	P40452	197 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	UFE1	P41834	346 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	FAR7	P43592	221 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	BOL2	P53082	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MON1	P53129	644 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GLO2	Q05584	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CDA1	Q06702	301 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SGO1	Q08490	590 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ESA1	Q08649	445 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RMD5	Q12508	421 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CSM1	P25651	190 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	BCK2	P33306	851 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GCS1	P35197	352 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TFA2	P36145	328 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MRPL40	P36534	297 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	STB5	P38699	743 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MUP3	P38734	546 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YHR131C	P38835	850 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PIK1	P39104	1066 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SLX8	P40072	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YFL052W	P43551	465 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YFL040W	P43562	540 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PET130	P47065	347 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	IMA1	P53051	589 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YGL108C	P53139	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GTR2	P53290	341 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RMI1	Q02685	241 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	DYN3	Q04949	312 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SPC2	Q04969	178 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	FAR10	Q06001	478 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NUS1	Q12063	375 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NSL1	Q12143	216 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MNL2	Q12205	849 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	UBX3	Q12229	455 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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