RNA–Protein interactions for RNA: YHR170W

NMD3, Transcript of Protein involved in nuclear export of the large ribosomal subunit, yeast

Gene NMD3, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD3	YHR170W	ATP25	Q03153	612 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	HRD3	Q05787	833 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	IZH4	Q99393	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SPE1	P08432	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PEP5	P12868	1029 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	HEM15	P16622	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PHO81	P17442	1178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	BEM3	P32873	1128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RRN3	P36070	627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	HMT1	P38074	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ERR3	P42222	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YFL052W	P43551	465 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	GUF1	P46943	645 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ZIP2	P53061	704 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	DAM1	P53267	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YGR127W	P53275	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	GPB1	Q08886	897 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	TAF10	Q12030	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SEY1	Q99287	776 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ADH4	P10127	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MAS1	P10507	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	EMC1	P25574	760 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MSH1	P25846	959 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	CDC20	P26309	610 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	THI80	P35202	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	VPS41	P38959	992 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	FHL1	P39521	936 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MET12	P46151	657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	HXT16	P47185	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	NIT3	P49954	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	NPY1	P53164	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ADA2	Q02336	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	HER2	Q03557	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ARA2	Q04212	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PIG1	Q06216	648 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RSC3	Q06639	885 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	OMS1	Q06668	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SDH5	Q08230	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
NMD3	YHR170W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YIH1	P25637	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	OAF3	P36023	863 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	BIT2	P38346	545 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	STL1	P39932	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	JHD1	P40034	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	FMP10	P40098	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ATM1	P40416	690 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	CHA4	P43634	648 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	TAH11	P47112	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	AAD4	Q07747	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ARP7	Q12406	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SOD2	P00447	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MSS18	P08593	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PDE1	P22434	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PEX1	P24004	1043 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PGS1	P25578	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	DSS4	P32601	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YME1	P32795	747 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	NUP120	P35729	1037 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RPC37	P36121	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MSR1	P38714	643 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SMF2	P38778	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SCC4	P40090	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YFL040W	P43562	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YFL012W	P43580	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RFX1	P48743	811 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SPT20	P50875	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PEX31	P53203	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MEP3	P53390	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	TEP1	P53916	434 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	GTR1	Q00582	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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