RNA–Protein interactions for RNA: YHR153C

SPO16, Transcript of Meiosis-specific protein involved in synaptonemal complex assembly, yeast

Gene SPO16, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO16	YHR153C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	MRP7	P12687	371 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YML037C	Q03703	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ECI1	Q05871	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	SDH5	Q08230	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	PEP1	P32319	1579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	HIR3	P47171	1648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	GCN4	P03069	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	KAR3	P17119	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	MGM1	P32266	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	STV1	P37296	890 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ELO1	P39540	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ERP2	P39704	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YTP1	P53584	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	CTI6	Q08923	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ARG81	P05085	880 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ASK1	P35734	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	TSC10	P38342	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	DBP8	P38719	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	FLO5	P38894	1075 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	AFG3	P39925	761 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	VRG4	P40107	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	MDV1	P47025	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	GLO1	P50107	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	VID30	P53076	958 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YGR066C	P53242	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	EFM6	P53970	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	GSH2	Q08220	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	AFT2	Q08957	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	RPB8	P20436	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	POL4	P25615	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YNL181W	P53878	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ARP9	Q05123	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YEH1	Q07804	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	HER1	Q12276	1246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	OCA4	P25366	362 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	PCL6	P40038	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YIR016W	P40572	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	RMD8	P43620	662 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	SGF73	P53165	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	MAK10	Q02197	733 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	NGL3	Q03210	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	UBX3	Q12229	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	SPE4	Q12455	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	TAF2	P23255	1407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	MET8	P15807	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	MNN2	P38069	597 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	IAH1	P41734	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	PTR3	P43606	678 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	MRX6	P48564	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	VPS75	P53853	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	BOP3	P53958	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	RGT2	Q12300	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ICT1	Q12385	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	PUT2	P07275	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	CBS1	P14066	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	BOS1	P25385	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	PGS1	P25578	521 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	PEP3	P27801	918 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	YKL100C	P34248	587 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	REG2	P38232	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	CCT6	P39079	546 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	PHO90	P39535	881 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	RGI2	P40188	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
SPO16	YHR153C	IRC8	P47046	822 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	DSD1	P53095	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	YNL234W	P53857	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO16	YHR153C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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