RNA–Protein interactions for RNA: YGR209C

TRX2, Transcript of Cytoplasmic thioredoxin isoenzyme, yeast

Gene TRX2, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRX2	YGR209C	MET13	P53128	600 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GET1	P53192	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NUP100	Q02629	959 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MMT1	Q03218	510 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SPO20	Q04359	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	HSP31	Q04432	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	BLS1	Q06071	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GMC2	Q06201	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	OPT2	Q06593	877 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ASA1	Q06822	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YEH2	Q07950	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ESA1	Q08649	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	UAF30	Q08747	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RMD5	Q12508	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SPE1	P08432	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MSS18	P08593	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	KAR9	P32526	644 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PTH2	P34222	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	UIP5	P36137	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YBR056W	P38081	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SLM4	P38247	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	IST2	P38250	946 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	CYC2	P38909	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NUP60	P39705	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	HPM1	P40481	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	KTR7	P40504	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	CAB2	P40506	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	FMP32	P43557	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	BST1	P43571	1029 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MPS3	P47069	682 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	IBD2	P53892	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ISU1	Q03020	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YML131W	Q03102	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GAS3	Q03655	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NUT2	Q06213	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
TRX2	YGR209C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NUS1	Q12063	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	UBX3	Q12229	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SEC63	P14906	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	TYR1	P20049	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MIH1	P23748	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	EMC1	P25574	760 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ADK2	P26364	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RAD27	P26793	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RPC82	P32349	654 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PTM1	P32857	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SKT5	P34226	696 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PTC1	P35182	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	TFA2	P36145	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YBR241C	P38142	488 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SIF2	P38262	535 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YHR045W	P38775	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YHR131C	P38835	850 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	DSS1	P39112	969 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MEP1	P40260	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	AGP3	P43548	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NAS6	P50086	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	VPS62	P53285	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	DSL1	P53847	754 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ASI2	P53895	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	DOS2	P54858	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ECM9	Q02202	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	FMP30	Q02883	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PIR3	Q03180	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GCN5	Q03330	439 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	CRN1	Q06440	651 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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