RNA–Protein interactions for RNA: YGL145W

TIP20, Transcript of Peripheral membrane protein required for COPI vesicle fusion to the ER, yeast

Gene TIP20, Length 2,106 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIP20	YGL145W	IPI3	P53877	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	RIA1	P53893	1110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
TIP20	YGL145W	DCI1	Q08558	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	APL4	Q12028	832 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	PRD1	P25375	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YME2	P32843	850 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	PPQ1	P32945	549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	HES1	P35843	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SER3	P40054	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	BUL1	P48524	976 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	HST1	P53685	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MRPL22	P53881	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ADA2	Q02336	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MFM1	Q02783	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	UBP16	Q02863	499 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	DLT1	Q04216	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	DON1	Q05610	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	VTA1	Q06263	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	RIB7	P33312	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	CCL1	P37366	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	PCH2	P38126	564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SLM4	P38247	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SKN7	P38889	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ALG5	P40350	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YJL163C	P46996	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SMC3	P47037	1230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YIP4	P53093	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	FIN1	Q03898	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SPH1	Q06160	661 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	BAG7	Q12128	409 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SEC39	Q12745	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ATG2	P53855	1592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	BPT1	P14772	1559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YKR073C	P36153	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	FMS1	P50264	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	EFM6	P53970	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	RSM28	Q03430	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	RTT109	Q07794	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MLH2	Q07980	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ENB1	Q08299	606 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	USV1	Q12132	391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	BUD4	P47136	1447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	UFD4	P33202	1483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	APN1	P22936	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SUR1	P33300	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	LST4	P34239	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MLC1	P53141	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	TAP42	Q04372	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	ATG9	Q12142	997 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	CLC1	P17891	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YBR144C	P34215	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	HCS1	P34243	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	PKP1	P40530	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	STB2	P46679	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	NMA2	P53204	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YGR151C	P53287	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MDY2	Q12285	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	MET3	P08536	511 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	STE4	P18851	423 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	PPH22	P23595	377 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	SIP1	P32578	815 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	TUL1	P36096	758 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	VPS54	Q12071	889 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TIP20	YGL145W	TAF3	Q12297	353 aa		4.9	□□□□□ -1.62

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