RNA–Protein interactions for RNA: YFL037W

TUB2, Transcript of Beta-tubulin, yeast

Gene TUB2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TUB2	YFL037W	MAD1	P40957	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	PET130	P47065	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	ARP4	P80428	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	OSH6	Q02201	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SLD7	Q08457	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RSC6	P25632	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	YCR099C	P25657	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	TAF14	P35189	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	YHR045W	P38775	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	MEF2	P39677	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	NDC80	P40460	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SAE2	P46946	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	YGR266W	P53326	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RSM10	Q03201	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	ROT1	Q03691	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	URH1	Q04179	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RRN11	Q04712	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	PFA4	Q12006	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	DIN7	Q12086	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RMD5	Q12508	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	GCR1	P07261	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	PET123	P17558	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	CDC20	P26309	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SKN1	P33336	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	TIP20	P33891	701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SQT1	P35184	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	THI80	P35202	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	HSE1	P38753	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	GIC1	P38785	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	YHR182W	P38870	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	MEP1	P40260	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	LRO1	P40345	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	YFL012W	P43580	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	HST3	P53687	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	COG6	P53959	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	ECM9	Q02202	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	VTI1	Q04338	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	VID22	Q05934	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RSC3	Q06639	885 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	GUP2	Q08929	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	FRE7	Q12333	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SPS1	P08458	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SPO16	P17122	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	HOP1	P20050	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	PTP1	P25044	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RIM11	P38615	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	MNN1	P39106	762 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	FAU1	P40099	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SPG5	P42933	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	NMD5	P46970	1048 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SPP2	Q02521	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	TRM12	Q04235	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	ACM1	Q08981	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	GPR1	Q12361	961 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	MEC1	P38111	2368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	GPA2	P10823	449 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	PEP5	P12868	1029 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
TUB2	YFL037W	CBF1	P17106	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	CLB1	P24868	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	GDA1	P32621	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SKT5	P34226	696 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	LRG1	P35688	1017 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	BYE1	P36106	594 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	DMA1	P38823	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	MTG2	P38860	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	HAT2	P39984	401 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	PFA3	P42836	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	RIM21	P48565	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	MPS2	P53159	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	VHS1	Q03785	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUB2	YFL037W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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