RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	NUP120	P35729	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	HES1	P35843	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	YGR079W	P53249	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	VAC14	Q06708	880 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	OPI1	P21957	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	SPO16	P17122	198 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	SPO11	P23179	398 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	HEL1	P36113	551 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	PLM2	Q04383	521 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	YML053C	Q04978	212 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	SWT1	Q12104	458 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	JIP3	O13555	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SPO12	P17123	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SWI3	P32591	825 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RIC1	P40395	1056 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	EFM4	P40516	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ASE1	P50275	885 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SNO4	Q04902	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	HSP32	Q08992	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SEC39	Q12745	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CNS1	P33313	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
PRD1	YCL057W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CTM1	P38818	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	PSD1	P39006	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	TRS85	P46944	698 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	MSY1	P48527	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	BAG7	Q12128	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	VCX1	Q99385	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	COX1	P00401	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RAD57	P25301	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SIP1	P32578	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	EFM2	P38347	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	MNT3	P40549	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CBK1	P53894	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	NGL3	Q03210	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RMT2	Q03305	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ARO10	Q06408	635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CYK3	Q07533	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YSP3	P25036	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CHS3	P29465	1165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	PSO2	P30620	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RPC34	P32910	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SAE2	P46946	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	VPS4	P52917	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RCO1	Q04779	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	STE23	Q06010	1027 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RSF2	P46974	1380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	CDC8	P00572	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	PMR1	P13586	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RPC25	P35718	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	FLO10	P36170	1169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	MRX1	P40050	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	FMP10	P40098	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SIP4	P46954	829 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YNR061C	P53747	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	YAT1	P80235	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	SOV1	Q04748	898 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RAD34	Q06665	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RRI2	Q12348	645 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	RAD3	P06839	778 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	ERG8	P24521	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	LAC1	P28496	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	MRP20	P32387	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRD1	YCL057W	NFU1	P32860	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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