RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0144	Q0144	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	SPC72	P39723	622 aa		4.26	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	PKP1	P40530	394 aa		4.26	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	SMC3	P47037	1230 aa		4.26	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	ARP1	P38696	384 aa		4.25	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	YOL057W	Q08225	711 aa		4.25	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	VPS17	P32913	551 aa		4.24	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	TGL2	P54857	326 aa		4.24	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	SEC62	P21825	274 aa		4.23	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	CLB4	P24871	460 aa		4.23	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	SNC1	P31109	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	APL4	Q12028	832 aa		4.23	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	AYT1	Q12226	474 aa		4.23	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	ECM15	P35195	104 aa		4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	SRO77	P38163	1010 aa		4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	UBA4	P38820	440 aa		4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	APJ1	P53940	528 aa		4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	SAM50	P53969	484 aa		4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	HIM1	Q06674	414 aa		4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	SSK1	Q07084	712 aa		4.22	□□□□□ -1.73
Q0144	Q0144	YKL133C	P36066	463 aa		4.21	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	PUG1	P40100	303 aa		4.21	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	SMK1	P41808	388 aa		4.21	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	THI20	Q08224	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	CDC15	P27636	974 aa		4.2	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TMA16	Q08687	178 aa		4.2	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	MPD2	Q99316	277 aa		4.2	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	SNF3	P10870	884 aa		4.19	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	PGS1	P25578	521 aa		4.19	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	HEM2	P05373	342 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	PMR1	P13586	950 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-C	P25383	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	YKL050C	P35736	922 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	SDT1	P53078	280 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	ATG9	Q12142	997 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	YMR087W	Q04299	284 aa		4.17	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	MSN2	P33748	704 aa		4.16	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	COG1	P53079	417 aa		4.16	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	DIC1	Q06143	298 aa		4.16	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	COX17	Q12287	69 aa		4.16	□□□□□ -1.74
Q0144	Q0144	MSS18	P08593	268 aa		4.15	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	TUL1	P36096	758 aa		4.15	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	MRPL36	P36531	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	NPR3	P38742	1146 aa		4.15	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	BTN2	P53286	410 aa		4.15	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	SPE2	P21182	396 aa		4.14	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	LAG1	P38703	411 aa		4.14	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	YMR160W	Q03823	816 aa		4.14	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	MLC2	Q06580	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	RER1	P25560	188 aa		4.13	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	ROT2	P38138	954 aa		4.13	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	ANS1	P38832	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	NPR2	P39923	615 aa		4.13	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	HIS6	P40545	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	HNT3	Q08702	217 aa		4.13	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	INP53	Q12271	1107 aa		4.13	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	ATR1	P13090	542 aa		4.12	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	PMU1	P36069	295 aa		4.12	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	TPK1	P06244	397 aa		4.11	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	UIP3	P39547	235 aa		4.11	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	MHR1	Q06630	226 aa		4.11	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	VPS52	P39904	641 aa		4.1	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.2 ms