RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575570.1

TBC1D28-208, Transcript of TBC1 domain family member 28, human

TSL 5

Gene TBC1D28, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D28-208	ENST00000575570	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	ZBED4	O75132	1171 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	KDM4A	O75164	1064 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	IGHA2	P01877	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	CCL5	P13501	91 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	CYP2B6	P20813	491 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	GJA8	P48165	433 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	PLS1	Q14651	629 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	TRIB2	Q92519	343 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	RNF208	Q9H0X6	261 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBC1D28-208	ENST00000575570	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570		B4E1Z4	1266 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	PDHB	P11177	359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	FCER1A	P12319	257 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ADORA2A	P29274	412 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	TRDN	Q13061	729 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SGPL1	O95470	568 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	DPP9	Q86TI2	863 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	FBXO40	Q9UH90	709 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ZNF536	O15090	1300 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	TNKS	O95271	1327 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570		E7EWF7	191 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	COBL	O75128	1261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CDC45	O75419	566 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	KCTD2	Q14681	263 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SEC23A	Q15436	765 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CCL14	Q16627	93 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	RIPK3	Q9Y572	518 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	TRIM32	Q13049	653 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MAML3	Q96JK9	1138 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	MMP19	Q99542	508 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TBC1D28-208	ENST00000575570	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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