RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 DCAF4Q8WV16 495 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 UTRNP46939 3433 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CYTH3O43739 400 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SCG2P13521 617 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 XBP1P17861 261 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZNF543Q08ER8 600 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 USP48Q86UV5 1035 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SHISA4Q96DD7 197 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GLTPD2A6NH11 291 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KRT85P78386 507 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CCDC181Q5TID7 509 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 BRAPQ7Z569 592 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 HOOK2Q96ED9 719 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.95□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 DCAF15Q66K64 600 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SLFN13Q68D06 897 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CPVLQ9H3G5 476 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PRG0 241 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ERICH4A6NGS2 130 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KIF4AO95239 1232 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CCDC96Q2M329 555 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KCTD1Q719H9 257 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FIBPO43427 364 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TRAK2O60296 914 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ASNSP08243 561 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GMCL1Q96IK5 515 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GINM1Q9NU53 330 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.94□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 F5H6K3 240 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 EPHX2P34913 555 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ECE1P42892 770 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KLRC3Q07444 240 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ATL3Q6DD88 541 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GOPCQ9HD26 462 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TMX2Q9Y320 296 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NDUFB10O96000 172 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KRT2P35908 639 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SLC1A4P43007 532 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SATB1Q01826 763 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ACER1Q8TDN7 264 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PIGSQ96S52 555 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SH2D4AQ9H788 454 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CFAP45Q9UL16 551 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 BTBD18B2RXH4 712 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 STXBP3O00186 592 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 OXER1Q8TDS5 423 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SPATA32Q96LK8 384 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.93□□□□□ -1.3
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