RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Smco2Q9DA21 347 aa10.46□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bpifb4A2BGH0 617 aa10.46□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Chp1P61022 195 aa10.46□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ncf1Q09014 390 aa10.46□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q3TYL0 343 aa10.46□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Il17raQ60943 864 aa10.46□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa10.46□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gjb4Q02738 266 aa10.46□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 LrmpQ60664 539 aa10.46□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slitrk3Q810B9 980 aa10.46□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NapaQ9DB05 295 aa10.46□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa10.46□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cnbd1B1AWM0 430 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gucy1b3O54865 620 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rnf40Q3U319 1001 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Map3k12Q60700 888 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc39a11Q8BWY7 342 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam161bQ8CB59 589 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tut1Q8R3F9 869 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdca7Q9D0M2 382 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cul5Q9D5V5 780 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tfap4Q9JIZ5 338 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ugt1a8D3Z748 530 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zscan18E9PUD6 809 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ugt1a10E9PXN7 530 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pdrg1P59048 133 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trappc10Q3TLI0 1259 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ckap2Q3V1H1 664 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spata4Q8K3V1 295 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Snapc4Q8BP86 1333 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ankrd35E9Q9D8 996 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dok7Q18PE0 504 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rhpn1Q61085 643 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Krtap5-3Q9D226 196 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MetP16056 1379 aa10.45□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppfibp2O35711 882 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sap30bpQ02614 308 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp1r7Q3UM45 361 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pramel6Q810Y9 485 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bbs9Q811G0 885 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Iqcb1Q8BP00 598 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dclk3Q8BWQ5 790 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dnajc17Q91WT4 303 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lzts2Q91YU6 671 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tktl2Q9D4D4 627 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Myo1cQ9WTI7 1063 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ankrd63A2ARS0 390 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ErmardE9Q048 622 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gucy1a2F8VQK3 730 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrrc36Q3V0M2 755 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Msl1Q6PDM1 616 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 RragaQ80X95 313 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gpt2Q8BGT5 522 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gps2Q921N8 327 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stx17Q9D0I4 301 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sgpp1Q9JI99 430 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tpp1O89023 562 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ctnna3Q65CL1 895 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hdac4Q6NZM9 1076 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Maip1Q8BHE8 291 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Shisa4Q8CA71 197 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Apopt1Q9CQW7 192 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gdf11Q9Z1W4 405 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cyp2ab1S4R196 498 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nfat5Q9WV30 1534 aa10.44□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Copb2O55029 905 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pth1rP41593 591 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kcnd1Q03719 651 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tcerg1lQ3B807 590 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Islr2Q5RKR3 745 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gas8Q60779 478 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ublcp1Q8BGR9 318 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Taf6lQ8R2K4 616 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Washc1Q8VDD8 475 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rcan1Q9JHG6 198 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Krt78E9Q0F0 1068 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nr1i2O54915 431 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdh15P33146 784 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ric8aQ3TIR3 530 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tsr1Q5SWD9 803 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 D130040H23RikQ8BII3 405 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CutaQ9CQ89 177 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trmt112Q9DCG9 125 aa10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vmn2r68L7N2B3 851 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.9 ms