Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Cul5Q9D5V5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Cul5Q9D5V5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Cul5Q9D5V5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cul5Q9D5V5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Cul5Q9D5V5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cul5Q9D5V5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Cul5Q9D5V5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cul5Q9D5V5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Cul5Q9D5V5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cul5Q9D5V5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cul5Q9D5V5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cul5Q9D5V5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cul5Q9D5V5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Cul5Q9D5V5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cul5Q9D5V5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Cul5Q9D5V5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Cul5Q9D5V5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cul5Q9D5V5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cul5Q9D5V5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cul5Q9D5V5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cul5Q9D5V5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cul5Q9D5V5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cul5Q9D5V5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cul5Q9D5V5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cul5Q9D5V5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cul5Q9D5V5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Cul5Q9D5V5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Cul5Q9D5V5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cul5Q9D5V5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cul5Q9D5V5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cul5Q9D5V5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cul5Q9D5V5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cul5Q9D5V5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cul5Q9D5V5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cul5Q9D5V5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul5Q9D5V5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul5Q9D5V5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cul5Q9D5V5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cul5Q9D5V5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cul5Q9D5V5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Cul5Q9D5V5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Cul5Q9D5V5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cul5Q9D5V5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cul5Q9D5V5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cul5Q9D5V5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cul5Q9D5V5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cul5Q9D5V5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cul5Q9D5V5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cul5Q9D5V5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul5Q9D5V5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cul5Q9D5V5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cul5Q9D5V5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Cul5Q9D5V5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cul5Q9D5V5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cul5Q9D5V5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul5Q9D5V5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul5Q9D5V5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul5Q9D5V5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cul5Q9D5V5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Cul5Q9D5V5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cul5Q9D5V5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cul5Q9D5V5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cul5Q9D5V5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cul5Q9D5V5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cul5Q9D5V5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cul5Q9D5V5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cul5Q9D5V5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cul5Q9D5V5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cul5Q9D5V5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cul5Q9D5V5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cul5Q9D5V5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cul5Q9D5V5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cul5Q9D5V5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Cul5Q9D5V5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Cul5Q9D5V5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cul5Q9D5V5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cul5Q9D5V5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Cul5Q9D5V5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Cul5Q9D5V5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cul5Q9D5V5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cul5Q9D5V5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cul5Q9D5V5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cul5Q9D5V5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cul5Q9D5V5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cul5Q9D5V5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cul5Q9D5V5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cul5Q9D5V5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cul5Q9D5V5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cul5Q9D5V5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cul5Q9D5V5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cul5Q9D5V5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cul5Q9D5V5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cul5Q9D5V5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cul5Q9D5V5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cul5Q9D5V5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Cul5Q9D5V5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cul5Q9D5V5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cul5Q9D5V5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cul5Q9D5V5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms