Protein–RNA interactions for Protein: O89023

Tpp1, Tripeptidyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpp1O89023 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Tpp1O89023 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Tpp1O89023 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Tpp1O89023 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Tpp1O89023 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Tpp1O89023 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Tpp1O89023 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tpp1O89023 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tpp1O89023 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tpp1O89023 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tpp1O89023 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tpp1O89023 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Tpp1O89023 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tpp1O89023 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tpp1O89023 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Tpp1O89023 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Tpp1O89023 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Tpp1O89023 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Tpp1O89023 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Tpp1O89023 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tpp1O89023 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tpp1O89023 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tpp1O89023 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tpp1O89023 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tpp1O89023 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tpp1O89023 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Tpp1O89023 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tpp1O89023 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tpp1O89023 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Tpp1O89023 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Tpp1O89023 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Tpp1O89023 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Tpp1O89023 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Tpp1O89023 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Tpp1O89023 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tpp1O89023 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tpp1O89023 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tpp1O89023 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tpp1O89023 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tpp1O89023 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Tpp1O89023 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Tpp1O89023 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tpp1O89023 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tpp1O89023 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Tpp1O89023 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tpp1O89023 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tpp1O89023 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tpp1O89023 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tpp1O89023 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tpp1O89023 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Tpp1O89023 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tpp1O89023 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tpp1O89023 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Tpp1O89023 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Tpp1O89023 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tpp1O89023 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tpp1O89023 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tpp1O89023 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tpp1O89023 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tpp1O89023 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Tpp1O89023 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tpp1O89023 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tpp1O89023 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tpp1O89023 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Tpp1O89023 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tpp1O89023 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tpp1O89023 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tpp1O89023 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tpp1O89023 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tpp1O89023 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tpp1O89023 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tpp1O89023 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tpp1O89023 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Tpp1O89023 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tpp1O89023 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tpp1O89023 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tpp1O89023 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tpp1O89023 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tpp1O89023 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tpp1O89023 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tpp1O89023 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tpp1O89023 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tpp1O89023 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tpp1O89023 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tpp1O89023 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tpp1O89023 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tpp1O89023 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tpp1O89023 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tpp1O89023 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tpp1O89023 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tpp1O89023 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tpp1O89023 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tpp1O89023 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Tpp1O89023 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tpp1O89023 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tpp1O89023 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tpp1O89023 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tpp1O89023 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tpp1O89023 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tpp1O89023 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms