Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,72■■■■■ 4,27
Cdh15P33146 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Cdh15P33146 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,72
Cdh15P33146 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,64
Cdh15P33146 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Cdh15P33146 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,45■■■■□ 3,59
Cdh15P33146 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,95■■■■□ 3,51
Cdh15P33146 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,28■■■■□ 3,4
Cdh15P33146 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Cdh15P33146 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,02■■■■□ 3,36
Cdh15P33146 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,95■■■■□ 3,35
Cdh15P33146 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Cdh15P33146 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,46■■■■□ 3,27
Cdh15P33146 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Cdh15P33146 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Cdh15P33146 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cdh15P33146 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,87■■■■□ 3,17
Cdh15P33146 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cdh15P33146 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Cdh15P33146 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Cdh15P33146 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Cdh15P33146 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Cdh15P33146 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Cdh15P33146 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Cdh15P33146 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Cdh15P33146 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Cdh15P33146 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,54■■■■□ 3,12
Cdh15P33146 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Cdh15P33146 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Cdh15P33146 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Cdh15P33146 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Cdh15P33146 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Cdh15P33146 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Cdh15P33146 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Cdh15P33146 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,01■■■■□ 3,04
Cdh15P33146 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Cdh15P33146 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
Cdh15P33146 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Cdh15P33146 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Cdh15P33146 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Cdh15P33146 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Cdh15P33146 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Cdh15P33146 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Cdh15P33146 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Cdh15P33146 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cdh15P33146 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Cdh15P33146 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Cdh15P33146 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Cdh15P33146 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Cdh15P33146 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Cdh15P33146 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Cdh15P33146 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Cdh15P33146 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Cdh15P33146 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Cdh15P33146 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,79■■■□□ 2,84
Cdh15P33146 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Cdh15P33146 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,82
Cdh15P33146 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Cdh15P33146 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Cdh15P33146 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Cdh15P33146 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Cdh15P33146 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Cdh15P33146 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
Cdh15P33146 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Cdh15P33146 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cdh15P33146 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,49■■■□□ 2,79
Cdh15P33146 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cdh15P33146 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Cdh15P33146 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Cdh15P33146 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
Cdh15P33146 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Cdh15P33146 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cdh15P33146 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Cdh15P33146 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Cdh15P33146 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Cdh15P33146 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Cdh15P33146 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Cdh15P33146 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Cdh15P33146 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Cdh15P33146 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Cdh15P33146 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Cdh15P33146 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Cdh15P33146 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Cdh15P33146 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Cdh15P33146 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Cdh15P33146 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Cdh15P33146 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Cdh15P33146 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Cdh15P33146 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Cdh15P33146 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Cdh15P33146 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Cdh15P33146 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Cdh15P33146 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Cdh15P33146 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Cdh15P33146 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Cdh15P33146 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,54■■■□□ 2,64
Cdh15P33146 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Cdh15P33146 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,51■■■□□ 2,64
Cdh15P33146 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Cdh15P33146 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms