RNA–Protein interactions for RNA: YOR299W

BUD7, Transcript of Member of the ChAPs family (Chs5p-Arf1p-binding proteins), yeast

Gene BUD7, Length 2,241 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD7	YOR299W	IZH4	Q99393	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	HMG1	P12683	1054 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	APE1	P14904	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PDE1	P22434	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PEX5	P35056	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	ATG12	P38316	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	LAM1	P38851	1228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	MND2	P40577	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RIM8	P53179	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RCF1	Q03713	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	NSE5	Q03718	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RKM2	Q03942	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	BSP1	Q06604	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	TPO1	Q07824	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	NUR1	Q12066	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	GPM3	Q12326	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	MLS1	P30952	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	HXT7	P39004	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RFX1	P48743	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	HNT2	P49775	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YGR016W	P53209	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	VPS9	P54787	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	ATP25	Q03153	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	GCN5	Q03330	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	URH1	Q04179	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RSC58	Q07979	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	GUP2	Q08929	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SPO16	P17122	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RPO26	P20435	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SLY1	P22213	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PEX1	P24004	1043 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YIH1	P25637	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	MEI4	P29467	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	AIM18	P38884	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YMR134W	P40207	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YJL132W	P47014	750 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YJR079W	P47126	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	TCB2	P48231	1178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YGR045C	P53229	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	KTR6	P54070	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	ATG23	Q06671	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	MCA1	Q08601	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	DAP1	Q12091	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	GNT1	Q12096	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RRD2	Q12461	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	CDC8	P00572	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RAD10	P06838	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PEX34	P25584	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	TOK1	P40310	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PIR3	Q03180	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SCM3	Q12334	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SFI1	Q12369	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	AI3	P03877	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	ADE8	P04161	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SGE1	P33335	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	ALG3	P38179	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	FLC2	P39719	783 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SAW1	P39735	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RET2	P43621	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YAP1802	P53309	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	TOF2	Q02208	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	BLS1	Q06071	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
BUD7	YOR299W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	AVL9	Q12500	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
BUD7	YOR299W	PEP5	P12868	1029 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	ENA1	P13587	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PPH22	P23595	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	MIH1	P23748	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YCR015C	P25616	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms