RNA–Protein interactions for RNA: YOL078W

AVO1, Transcript of Component of a membrane-bound complex containing the Tor2p kinase, yeastyeast

Gene AVO1, Length 3,531 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1YOL078W DEP1P31385 405 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W SDS22P36047 338 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W EHT1P38295 451 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W CBR1P38626 284 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W LSC1P53598 329 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W DSE4P53753 1117 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W HAP5Q02516 242 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W SOG2Q08817 791 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W TCO89Q08921 799 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W YLL058WQ12198 575 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W COX17Q12287 69 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W CDC19P00549 500 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W PWP1P21304 576 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W RRT2P38332 387 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W ELO3P40319 345 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W COG1P53079 417 aa5.78□□□□□ -1.48
AVO1YOL078W SEC53P07283 254 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W CDC4P07834 779 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W ITR1P30605 584 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W MIP6P38760 659 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W GLO1P50107 326 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W SRT1Q03175 343 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W AIM6Q07716 390 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W PTC5Q12511 572 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data5.77□□□□□ -1.49not detected
AVO1YOL078W MND2P40577 368 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W ULI1P43604 169 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W PTR2P32901 601 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W ARH1P48360 493 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W YEH1Q07804 573 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W NCR1Q12200 1170 aa5.77□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W SNF5P18480 905 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W LTV1P34078 463 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W YKR015CP36111 568 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W BUD8P41698 603 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W ALY2P47029 1046 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W TRF5P48561 642 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W CUE3P53137 624 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W MEC3Q02574 474 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W SMA1Q02651 245 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W GIS3Q12418 502 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W AFI1Q99222 893 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RSN1Q03516 953 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W ASM4Q05166 528 aa5.76□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W WBP1P33767 430 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W ARL1P38116 183 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W FLR1P38124 548 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W EFM2P38347 419 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W PIH1P38768 344 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W VPS4P52917 437 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W YGL185CP53100 379 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RCM1P53972 490 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W GGA1Q06336 557 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W TAL1P15019 335 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W SYN8P31377 255 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W UBP11P36026 717 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W YKL070WP36087 169 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W FSH1P38777 243 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W PPE1P38796 400 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W MNN9P39107 395 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W PXA1P41909 870 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W AHC1Q12433 566 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W DGR2P32330 852 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W PNC1P53184 216 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RHO5P53879 331 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W SRL4Q03085 281 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RCN2Q12044 265 aa5.75□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W YCL068CP25593 260 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W TOS1P38288 455 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W BZZ1P38822 633 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RPN10P38886 268 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W SHU2P38957 223 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W YGL138CP53122 345 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W CRD1Q07560 283 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W BUD7Q08754 746 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W ACM1Q08981 209 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W ATG11Q12527 1178 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W VPS63O13549 108 aa5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W HXT3P32466 567 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W HAM1P47119 197 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
AVO1YOL078W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.4 ms