RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	SPO20	Q04359	397 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	ENT4	Q07872	247 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	ALR1	Q08269	859 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MPD2	Q99316	277 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	HEM2	P05373	342 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RAD3	P06839	778 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	BET2	P20133	325 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SGF29	P25554	259 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YJU3	P28321	313 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YHR131C	P38835	850 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MEP1	P40260	492 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SLM2	P53955	656 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YHM2	Q04013	314 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	CRN1	Q06440	651 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	UBX3	Q12229	455 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	STB3	Q12427	513 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	NMT1	P14743	455 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	PHO3	P24031	467 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SNT1	P25357	1226 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	VRP1	P37370	817 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YBR259W	P38338	688 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MED6	P38782	295 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RSM7	P47150	247 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	AIF1	P52923	378 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	HDA3	Q06623	655 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YOL019W	Q08157	551 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YPL247C	Q12523	523 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SEM1	O94742	89 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	HIS5	P07172	385 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SEC15	P22224	910 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	BRF1	P29056	596 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	PTM1	P32857	523 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	FRT2	P39734	528 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	MGS1	P40151	587 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	RMD8	P43620	662 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	CLD1	P53264	445 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	CIA1	Q05583	330 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	YDL121C	Q07541	149 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	BUD7	Q08754	746 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	DAP1	Q12091	152 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	YOR012W	Q12351	137 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	ICT1	Q12385	394 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	GTT2	Q12390	233 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	MRPL9	P31334	269 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	THI80	P35202	319 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	FZO1	P38297	855 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	ATH1	P48016	1211 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	NNF2	P53253	936 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	RMI1	Q02685	241 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	YPL109C	Q02981	657 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	CCE1	Q03702	353 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	GTB1	Q04924	702 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	VTA1	Q06263	330 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	RAD59	Q12223	238 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	MSF1	P08425	469 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	KEX2	P13134	814 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	STE5	P32917	917 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SKT5	P34226	696 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	YKL097C	P34245	136 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	EFM1	P38732	585 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	YHR045W	P38775	560 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SHU2	P38957	223 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	COA1	P40452	197 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	PRM2	P40534	656 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	IRR1	P40541	1150 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.81	□□□□□ -0.68	RIP-Chip
DDR2	YOL052C-A	RCO1	Q04779	684 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	NSE1	Q07913	336 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	ATG34	Q12292	412 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SPS1	P08458	490 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	PPZ1	P26570	692 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	LRG1	P35688	1017 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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