RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	BOS1	P25385	244 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	RER1	P25560	188 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	EMC1	P25574	760 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	RPD3	P32561	433 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	RAD24	P32641	659 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	KAE1	P36132	386 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	MRPL7	P36519	292 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SCC4	P40090	624 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	MSS2	P40990	351 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	YFH7	P43591	353 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	YJR056C	P47115	236 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	YGR111W	P53265	400 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SOL4	P53315	255 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SNF12	P53628	566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	RSM24	Q03976	319 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	MLC2	Q06580	163 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
MSE1	YOL033W	TRE2	Q08693	809 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	AKR2	Q12013	749 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	UFD4	P33202	1483 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	PHO5	P00635	467 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	GPA2	P10823	449 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	BAS1	P22035	811 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	CMK2	P22517	447 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SUA5	P32579	426 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	BEM3	P32873	1128 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	KTR4	P38131	464 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SIF2	P38262	535 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	NET1	P47035	1189 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	YJR054W	P47114	497 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	BRO1	P48582	844 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	YGR042W	P53227	271 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	CWC24	P53769	259 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	RAD30	Q04049	632 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SPH1	Q06160	661 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	PUS9	Q12069	462 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	PNS1	Q12412	539 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	SKS1	Q12505	502 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	MDM12	Q92328	271 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	MTR10	Q99189	972 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSE1	YOL033W	GAL7	P08431	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	UNG1	P12887	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	VPS34	P22543	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	CTR86	P25355	563 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	NIC96	P34077	839 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	CTF13	P35203	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	HMT1	P38074	348 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YBR225W	P38321	900 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YAR028W	P39548	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	PZF1	P39933	429 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ACA1	P39970	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ASG1	P40467	964 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YGR127W	P53275	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	EOS1	P53938	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	VAC7	P53950	1165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ACS1	Q01574	713 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SMA1	Q02651	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	UGO1	Q03327	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	WAR1	Q03631	944 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	MUM3	Q08750	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ISA2	Q12425	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	AAC3	P18238	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	CKI1	P20485	582 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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