RNA–Protein interactions for RNA: YMR047C

NUP116, Transcript of FG-nucleoporin component of central core of the nuclear pore complex, yeast

Gene NUP116, Length 3,342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP116	YMR047C	INH1	P01097	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MRPL17	P36528	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YAP5	P40574	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MMM1	P41800	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	NUP85	P46673	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SAP4	P53036	818 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	TEL2	P53038	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ERG5	P54781	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	CDC55	Q00362	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	RSM24	Q03976	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	THI7	Q05998	598 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SRN2	Q99176	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	PBS2	P08018	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MNE1	P24720	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MET22	P32179	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MDJ1	P35191	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	HSL7	P38274	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	EXO5	P38289	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	RFX1	P48743	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	TAD1	P53065	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MRM2	P53123	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	IVY1	Q04934	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	PER33	Q12144	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	UBR1	P19812	1950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	GAL1	P04385	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ATP4	P05626	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	CHK1	P38147	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YEL075C	P39972	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	AGX1	P43567	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	COQ5	P49017	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ZIP2	P53061	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	LOT6	Q07923	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YME1	P32795	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	RPC25	P35718	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	QDR2	P40474	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	BNA1	P47096	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YNL144C	P53907	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	TEP1	P53916	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	TFB2	Q02939	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	TFB3	Q03290	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	CCE1	Q03702	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	DYN3	Q04949	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	THI21	Q08975	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	PIN2	Q12057	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MSF1	P08425	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	DAL81	P21657	970 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MRPL8	P22353	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	EMC1	P25574	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ITR2	P30606	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	PCA1	P38360	1216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YHL012W	P38709	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ASG1	P40467	964 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	AGE2	P40529	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SAP185	P40856	1058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	KTR6	P54070	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SHE9	Q04172	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MST1	P07236	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SRP101	P32916	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	PEX32	P38292	413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MED6	P38782	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	IES5	P40060	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	RSM7	P47150	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ILM1	P47155	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YPR003C	P53394	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	FYV6	P53913	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	GMC2	Q06201	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	DXO1	Q06349	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	MCM21	Q06675	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SIL1	Q08199	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ATG29	Q12092	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	SKM1	Q12469	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	DAP2	P18962	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUP116	YMR047C	ADY2	P25613	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11 ms