RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A RSM28Q03430 361 aa2.76□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A TMA64Q04600 565 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A VAM6Q07468 1049 aa2.76□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A CBS2P14905 389 aa2.75□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A ATS1P31386 333 aa2.75□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A ERG1P32476 496 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A YER130CP39959 443 aa2.75□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A PUG1P40100 303 aa2.75□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A GUF1P46943 645 aa2.75□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A TRS130Q03660 1102 aa2.75□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A YOL159CQ08300 171 aa2.75□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A MSS18P08593 268 aa2.74□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A KRS1P15180 591 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A CLB4P24871 460 aa2.74□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A HIS6P40545 261 aa2.74□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A BOR1P53838 576 aa2.74□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A ADD37Q03233 198 aa2.74□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A GDH1P07262 454 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A AGA1P32323 725 aa2.73□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A MIC60P36112 540 aa2.73□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A MDM31P38880 579 aa2.73□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A SSB1P11484 613 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A SPO16P17122 198 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A TIF3P34167 436 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A NUP120P35729 1037 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A YKL133CP36066 463 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A ARP1P38696 384 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A PHO90P39535 881 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A YEL068CP39977 110 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A SSB2P40150 613 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A SPG5P42933 373 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A NNF2P53253 936 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A MET14Q02196 202 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A TMA16Q08687 178 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A YLL056CQ12177 298 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A PCD1Q12524 340 aa2.72□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A GAL1P04385 528 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A MCM4P30665 933 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A ESL2P36168 1195 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A MRPL4P36517 319 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A FAA2P39518 744 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RGI2P40188 164 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A IKS1P47042 667 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A YDL186WP48568 277 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A PEX8P53248 589 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RBA50Q04418 439 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A FMP45Q07651 309 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A COX17Q12287 69 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A NCP1P16603 691 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A ACH1P32316 526 aa2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A SWH1P35845 1188 aa2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A PHD1P36093 366 aa2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A SPC34P36131 295 aa2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A SHE10P53075 577 aa2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A ADE13Q05911 482 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A MLC2Q06580 163 aa2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A YOL057WQ08225 711 aa2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RDR1Q08904 546 aa2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A GAC1P28006 793 aa2.69□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A SRB5P32585 307 aa2.69□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A MIA40P36046 403 aa2.69□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A VPS27P40343 622 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A COG1P53079 417 aa2.69□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A ATG26Q06321 1198 aa2.69□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RRP6Q12149 733 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-LR1P0C2J4 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-FP0CX61 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-GR2P0CX62 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A MCK1P21965 375 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-CP25383 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A LDB16P25587 256 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A PCA1P38360 1216 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RPH1P39956 796 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A MKT1P40850 830 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A YJL213WP40896 331 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A YPI1P43587 155 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A CTF18P49956 741 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A SOL4P53315 255 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-DR2Q03483 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A MSS11Q03825 758 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-BQ12260 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-OR2Q12293 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-DR1Q12392 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-OR1Q12439 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TY2A-DR3Q99303 438 aa2.68□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A AGP2P38090 596 aa2.67□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RPR2P40571 144 aa2.67□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A AXL1P40851 1208 aa2.67□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RPN11P43588 306 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A ASE1P50275 885 aa2.67□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TAN1P53072 289 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.8 ms