RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	SAE2	P46946	345 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	CTK2	P46962	323 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	GRX6	Q12438	231 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	AQY1	P0CD91	305 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	MAK32	P23060	363 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	REG2	P38232	338 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	MET18	P40469	1032 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	JJJ1	P53863	590 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	ATG9	Q12142	997 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	RTN2	Q12443	393 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	ORC2	P32833	620 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	YKL050C	P35736	922 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	SRO77	P38163	1010 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	MUM2	P38236	366 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	YEL057C	P39983	233 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	AXL1	P40851	1208 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	STU2	P46675	888 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	SMC3	P47037	1230 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	THI3	Q07471	609 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	PET111	P08468	800 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	PDX1	P16451	410 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	APD1	P38281	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	FTH1	P38310	465 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	BUR6	P40096	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	CDC1	P40986	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	DIA3	P52290	468 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	YPR003C	P53394	754 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	EFM6	P53970	246 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	BUD7	Q08754	746 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	INP53	Q12271	1107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	SUT2	Q12286	268 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	SPO11	P23179	398 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	RPC53	P25441	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	UBP11	P36026	717 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	BYE1	P36106	594 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	CST26	P38226	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	YJL043W	P47053	257 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	VID30	P53076	958 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	LCL3	P53153	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	BOP3	P53958	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	MAK10	Q02197	733 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	BI2	P03873	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	ADY2	P25613	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	VID24	P38263	362 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	SMF1	P38925	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	YFR020W	P43600	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	FAR3	P46671	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	YML6	P51998	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	ZDS2	P54786	942 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	VPS38	Q05919	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	BSP1	Q06604	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	AVL9	Q12500	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS31	YLR167W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	MNN2	P38069	597 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ERV46	P39727	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	FIN1	Q03898	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	RIM20	Q12033	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SPE2	P21182	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YBR144C	P34215	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SEF1	P34228	1148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ELO1	P39540	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
RPS31	YLR167W	CIN1	P40987	1014 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	IRC8	P47046	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YGR127W	P53275	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	MDG1	P53885	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ARO10	Q06408	635 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	RTT109	Q07794	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	CHO1	P08456	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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