RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	PSK2	Q08217	1101 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	CLB2	P24869	491 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	MET30	P39014	640 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YER010C	P40011	234 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	IME4	P41833	600 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	STB2	P46679	850 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	SGF73	P53165	657 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YTP1	P53584	459 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YNL234W	P53857	426 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YNL181W	P53878	407 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	BET4	Q00618	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ARP10	Q04549	284 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	RCO1	Q04779	684 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YLR281C	Q05863	155 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	MRP20	P32387	263 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	STV1	P37296	890 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	LEU5	P38702	357 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	AXL2	P38928	823 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	PKP1	P40530	394 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YML131W	Q03102	365 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	SNO4	Q04902	237 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	HSP32	Q08992	237 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSE4	YKL049C	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	GCS1	P35197	352 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	HXT9	P40885	567 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	SAD1	P43589	448 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	NNF2	P53253	936 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	MUB1	Q03162	620 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YMR254C	Q04838	102 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	GRS2	Q06817	618 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	NBP2	Q12163	236 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	EDE1	P34216	1381 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	RPB8	P20436	146 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	MGR1	P25573	417 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	RRN3	P36070	627 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	ALY1	P36117	915 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YPK3	P38070	525 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	RKM3	P38222	552 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	EFM2	P38347	419 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	SLZ1	P40167	298 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	SMC3	P47037	1230 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YOL159C	Q08300	171 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	ATG9	Q12142	997 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	CBF2	P32504	956 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	PDR3	P33200	976 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	MIA40	P36046	403 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YAT2	P40017	923 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	FMP10	P40098	244 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	IAH1	P41734	238 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	MAK10	Q02197	733 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	EKI1	Q03764	534 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	FMP42	Q04991	504 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	SSP2	Q08646	371 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	APL4	Q12028	832 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	INP53	Q12271	1107 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	GAC1	P28006	793 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YKL050C	P35736	922 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	UIP3	P39547	235 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YND1	P40009	630 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	AAD10	P47182	288 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	CBK1	P53894	756 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	INA17	Q02888	182 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	TAH18	Q12181	623 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	HNM1	P19807	563 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	SPE2	P21182	396 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	RER1	P25560	188 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	DPB3	P27344	201 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	RAD24	P32641	659 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	BZZ1	P38822	633 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	BUR6	P40096	142 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YJR061W	P40355	935 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YIL060W	P40519	144 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	RTS2	P40962	232 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	MAF1	P41910	395 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	INN1	P53901	409 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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