RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	TYR1	P20049	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SPE2	P21182	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	AEP2	P22136	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PRE8	P23639	250 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	NTA1	P40354	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	QRI7	P43122	407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GLG2	P47011	380 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	NUT1	P53114	1132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SGF73	P53165	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	BOP3	P53958	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RCO1	Q04779	684 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	FAR8	Q05040	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	BLS1	Q06071	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MET17	P06106	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MLS1	P30952	554 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MKS1	P34072	584 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GPT2	P36148	743 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	STS1	P38637	319 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	FHL1	P39521	936 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SEN34	P39707	275 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YER085C	P40058	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	LYS14	P40971	790 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GAB1	P41733	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	OTU1	P43558	301 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CCC1	P47818	322 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SOL4	P53315	255 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	REG1	Q00816	1014 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SWP1	Q02795	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	FCP1	Q03254	732 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ATC1	Q04005	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MSC3	Q05812	728 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RAD59	Q12223	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
MSC7	YHR039C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	DAD2	P36162	133 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CDS1	P38221	457 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SUL1	P38359	859 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PIC2	P40035	300 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ALG8	P40351	577 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YAP5	P40574	245 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	THI6	P41835	540 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ASK10	P48361	1146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RPA14	P50106	137 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MND1	P53102	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YMD8	Q03697	442 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SPO75	Q07798	868 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	BDS1	Q08347	646 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YOR238W	Q08634	303 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	TCO89	Q08921	799 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	VAM3	Q12241	283 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RTN2	Q12443	393 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CCP1	P00431	361 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MTF2	P10849	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CBF1	P17106	351 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ADK2	P26364	225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MCD4	P36051	919 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RFC5	P38251	354 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	WSS1	P38838	269 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	FMO1	P38866	432 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	FAA3	P39002	694 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YMR134W	P40207	237 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	NIT2	P47016	307 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YJR054W	P47114	497 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	NPA3	P47122	385 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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