RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W DIA3P52290 468 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W RKM2Q03942 479 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ARP10Q04549 284 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W MRX10Q05648 414 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SGT1Q08446 395 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W COX6P00427 148 aa12.71□□□□□ -0.37
SSA4YER103W TFA2P36145 328 aa12.71□□□□□ -0.37
SSA4YER103W VMA13P41807 478 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SSA4YER103W REC8Q12188 680 aa12.71□□□□□ -0.37
SSA4YER103W GAL10P04397 699 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W DED1P06634 604 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W APE2P32454 952 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W GCD11P32481 527 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YKL222CP35995 705 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ECM8P38246 354 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W RIM11P38615 370 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YHI9P38765 294 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YHR182WP38870 785 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W MND1P53102 219 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W CLD1P53264 445 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W RBG2P53295 368 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W MRPL13Q02204 264 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ECM30Q06673 1274 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W THI21Q08975 551 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W PTC6P25646 442 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W FAD1P38913 306 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SER3P40054 469 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W RPT2P40327 437 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SLM2P53955 656 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W LSM3P57743 89 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W FMP25Q08023 583 aa12.7□□□□□ -0.38
SSA4YER103W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SAM1P10659 382 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ABF1P14164 731 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W NSP1P14907 823 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W TGL1P34163 548 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W STB6P36085 766 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YMC2P38087 329 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W RPH1P39956 796 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W REF2P42073 533 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YJL132WP47014 750 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W GNP1P48813 663 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W CUL3P53202 744 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W TRM12Q04235 462 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W PEX12Q04370 399 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YLR455WQ06188 304 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W GUD1Q07729 489 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YOL036WQ08206 761 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W HOS1Q12214 470 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W LAA1P39526 2014 aa12.69□□□□□ -0.38
SSA4YER103W INO1P11986 533 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YPK1P12688 680 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W NMT1P14743 455 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W PHO91P27514 894 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W PMI40P29952 429 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YHR218WP38899 603 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W AIM23P47015 356 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W MTC3P53077 123 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ARO8P53090 500 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ATG20Q07528 640 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ATG34Q12292 412 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W TRP3P00937 484 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ART10P18634 518 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W DBF2P22204 572 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W RBG1P39729 369 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W HOC1P47124 396 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YJR098CP47139 656 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W NRT1Q08485 598 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W HFI1Q12060 488 aa12.68□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ROT2P38138 954 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W VMA7P39111 118 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W FIR1P40020 876 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W MAF1P41910 395 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SPR6Q01684 191 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YPL107WQ02873 248 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ISU1Q03020 165 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W APC4Q04601 652 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SHS1Q07657 551 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W RTT10Q08924 1013 aa12.67□□□□□ -0.38
SSA4YER103W CCP1P00431 361 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W COX4P04037 155 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SSA1P10591 642 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W WHI2P12611 486 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data12.66□□□□□ -0.38not detected
SSA4YER103W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data12.66□□□□□ -0.38not detected
SSA4YER103W YSP3P25036 478 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SRP101P32916 621 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W AIM18P38884 321 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W LYS9P38999 446 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W RRT5P43607 289 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W MRPL50P53724 139 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SLD7Q08457 257 aa12.66□□□□□ -0.38
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