RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W MGM1P32266 881 aa3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W SAC1P32368 623 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W TMT1P32643 299 aa3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YEL068CP39977 110 aa3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W PKP1P40530 394 aa3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W INA17Q02888 182 aa3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W CAC2Q04199 468 aa3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YOL159CQ08300 171 aa3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W ATG9Q12142 997 aa3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W NKP1Q12493 238 aa3.24□□□□□ -1.89
NTF2YER009W CLB2P24869 491 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W GND1P38720 489 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YIR016WP40572 265 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W LYS14P40971 790 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W MDV1P47025 714 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W NNF2P53253 936 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YTP1P53584 459 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W SEC5P89102 971 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YSA1Q01976 231 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W RAD30Q04049 632 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W POS5Q06892 414 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YDL121CQ07541 149 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W GSH2Q08220 491 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YDR056CQ12025 205 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YLR112WQ12130 139 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YOR111WQ99210 232 aa3.23□□□□□ -1.89
NTF2YER009W CDC16P09798 840 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W PRE8P23639 250 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W PDB1P32473 366 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W UIP3P39547 235 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W BUR6P40096 142 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W VRG4P40107 337 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W SMC3P47037 1230 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W PSR1Q07800 427 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W YAP7Q08182 245 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W TCO89Q08921 799 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.22□□□□□ -1.89not detected
NTF2YER009W INP53Q12271 1107 aa3.22□□□□□ -1.89
NTF2YER009W KRS1P15180 591 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W PWP1P21304 576 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W GFD2P25370 566 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W LEU5P38702 357 aa3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W RTS1P38903 757 aa3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W MPS1P54199 764 aa3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W IZH1Q03419 316 aa3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W YKU80Q04437 629 aa3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W MCP2Q06567 569 aa3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W UBX3Q12229 455 aa3.21□□□□□ -1.9
NTF2YER009W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W VMA16P23968 213 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W PAH1P32567 862 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W YKL050CP35736 922 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W MAL33P38157 468 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W NOP16P40007 231 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W SNM1P40993 198 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W SGF73P53165 657 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W YPL068CQ02749 293 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W ARP10Q04549 284 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W ECI1Q05871 280 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W APL4Q12028 832 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W ENT1Q12518 454 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa3.2□□□□□ -1.9
NTF2YER009W CBP1P07252 654 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W RPB8P20436 146 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W SPE2P21182 396 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W SAN1P22470 610 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W YCK1P23291 538 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W ATO2P32907 282 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W MIA40P36046 403 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W MNN2P38069 597 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W AGP2P38090 596 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W YBL029WP38201 376 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W PCL6P40038 420 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W TMA108P40462 946 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W HXT9P40885 567 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W DIA3P52290 468 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W STR3P53101 465 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W DUO1P53168 247 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W BOP3P53958 396 aa3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W SUB1P54000 292 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
NTF2YER009W MAK10Q02197 733 aa3.19□□□□□ -1.9
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