RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 SEPT2Q15019 361 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 MORN1Q5T089 497 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 NBPF3Q9H094 633 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CABP5Q9NP86 173 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 INCENPQ9NQS7 918 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 RLFQ13129 1914 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.09■■□□□ 1.13
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PUF60-218ENST00000531995 CAPN2P17655 700 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP6NLQ92738 828 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 SWAP70Q9UH65 585 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 SYN1P17600 705 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 PFASO15067 1338 aa22.07■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 FGRP09769 529 aa22.07■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 MAP4K1Q92918 833 aa22.07■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 BTBD7Q9P203 1132 aa22.07■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
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PUF60-218ENST00000531995 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 AKR1B1P15121 316 aa22.06■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 RASA1P20936 1047 aa22.06■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 CCNA1P78396 465 aa22.06■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 MAP2K5Q13163 448 aa22.06■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.06■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 COL6A3P12111 3177 aa22.05■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 A0A1W2PRG0 241 aa22.05■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 HAND2P61296 217 aa22.05■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.05■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 PRDM1O75626 825 aa22.04■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.04■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 LRCH3Q96II8 777 aa22.04■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.03■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 CCDC17Q96LX7 622 aa22.03■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.03■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.03■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 LAMA4Q16363 1823 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 A0A1W2PPC1 479 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 ZNF213O14771 459 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 PTPREP23469 700 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 GRB14Q14449 540 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 LHX8Q68G74 356 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 LBX2Q6XYB7 198 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-218ENST00000531995 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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PUF60-218ENST00000531995 CYP21A2P08686 494 aa22.01■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 CASC1Q6TDU7 716 aa22.01■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.01■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.01■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 GDF15Q99988 308 aa22.01■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 ORC4O43929 436 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 COL6A1P12109 1028 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 ICA1Q05084 483 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 PDE4BQ07343 736 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 STAG1Q8WVM7 1258 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 ANO2Q9NQ90 1003 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 CNGA1P29973 690 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 CYP2C19P33261 490 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 NECTIN1Q15223 517 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 ATP2B2Q01814 1243 aa21.98■■□□□ 1.11
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PUF60-218ENST00000531995 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 LTBP2Q14767 1821 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 FLOT1O75955 427 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 ADORA2AP29274 412 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 TFAP4Q01664 338 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-218ENST00000531995 PLS1Q14651 629 aa21.97■■□□□ 1.11
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