RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 FCER1AP12319 257 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 GUCY1A2P33402 732 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CCL14Q16627 93 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 VCPKMTQ9H867 229 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ATP5JP18859 108 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ADORA2AP29274 412 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 RTP1P59025 263 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 LRCH3Q96II8 777 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 TOX2Q96NM4 488 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ATP2A1O14983 1001 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PLCD1P51178 756 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 SEPT2Q15019 361 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 SBK1Q52WX2 424 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 C12orf60Q5U649 245 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 RNF180Q86T96 592 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ACER1Q8TDN7 264 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CRBNQ96SW2 442 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 FLRT1Q9NZU1 646 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA0355O15063 1070 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ERCC3P19447 782 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ADD2P35612 726 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ICA1Q05084 483 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MAML3Q96JK9 1138 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 HAUS7Q99871 368 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 RARBP10826 455 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 SYN1P17600 705 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 GNAT2P19087 354 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CNGA1P29973 690 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 OAZ1P54368 228 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 NKX3-2P78367 333 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 KCTD2Q14681 263 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 WDR78Q5VTH9 848 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 TRPV1Q8NER1 839 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 NYAP2Q9P242 653 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 FBXO40Q9UH90 709 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 FLOT1O75955 427 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 AKR1A1P14550 325 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC41Q15345 812 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MMP19Q99542 508 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 TNNQ9UQP3 1299 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CDK8P49336 464 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 TINF2Q9BSI4 451 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PANK2Q9BZ23 570 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1W2PRG0 241 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 COBLO75128 1261 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CYP2C19P33261 490 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 TKFCQ3LXA3 575 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 LCORLQ8N3X6 602 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF592Q92610 1267 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 GPATCH3Q96I76 525 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MAF1Q9H063 256 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms