RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.11■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.1■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.1■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.1■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 NYAP2Q9P242 653 aa25.1■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 STAP2Q9UGK3 403 aa25.1■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.1■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 M0R2C6 588 aa25.09■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 COBLO75128 1261 aa25.09■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 PLS1Q14651 629 aa25.09■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.09■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 TRPV1Q8NER1 839 aa25.09■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.09■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.08■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 DNM1LO00429 736 aa25.08■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 VWA5AO00534 786 aa25.08■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 FCER1AP12319 257 aa25.08■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 COPB2P35606 906 aa25.08■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 TDO2P48775 406 aa25.08■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.08■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.07■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.07■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 CNGA1P29973 690 aa25.07■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 REPS2Q8NFH8 660 aa25.07■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.07■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.06■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 MYH4Q9Y623 1939 aa25.06■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT4O43236 478 aa25.06■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.06■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.06■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.06■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 MAML3Q96JK9 1138 aa25.06■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 MX1P20591 662 aa25.05■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.05■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.05■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 F5H6K3 240 aa25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 STAT3P40763 770 aa25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 KLRC3Q07444 240 aa25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 MKL1Q969V6 931 aa25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 MMP19Q99542 508 aa25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 FSD1Q9BTV5 496 aa25.04■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFB10O96000 172 aa25.03■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 APPP05067 770 aa25.03■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 SYN1P17600 705 aa25.03■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.03■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 ATP2A1O14983 1001 aa25.02■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 RAD21O60216 631 aa25.02■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD2Q14681 263 aa25.02■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.02■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.02■■□□□ 1.6
LIMS1-208ENST00000428064 PDE4BQ07343 736 aa25.01■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.01■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.01■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.01■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 CEP95Q96GE4 821 aa25.01■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.01■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL1O95922 423 aa25■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 NAPBQ9H115 298 aa25■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 PRDM1O75626 825 aa24.99■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 PPARAQ07869 468 aa24.99■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 GPR153Q6NV75 609 aa24.99■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 TDHQ8IZJ6 230 aa24.99■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.99■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 TINF2Q9BSI4 451 aa24.99■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 KBTBD13C9JR72 458 aa24.98■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.98■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 TICAM2Q86XR7 235 aa24.98■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 PGK2P07205 417 aa24.97■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 TSPY3P0CV98 308 aa24.97■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 TSPY8P0CW00 308 aa24.97■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 CRBNQ96SW2 442 aa24.97■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 FEM1BQ9UK73 627 aa24.97■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 FOXP2O15409 715 aa24.96■■□□□ 1.59
LIMS1-208ENST00000428064 OAZ1P54368 228 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms