RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
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RABGEF1-201ENST00000284957 ANO1Q5XXA6 986 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM179Q6ZVK1 233 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-201ENST00000284957 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-201ENST00000284957 LZTS2Q9BRK4 669 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-201ENST00000284957 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.685e-8■□□□□ 8.1
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RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHA4Q9UN74 947 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQ27 194 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQ64 194 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQD8 194 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP6R2O75170 966 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-201ENST00000284957 CAP2P40123 477 aa10.73□□□□□ -0.69
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