RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
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ODC1-201ENST00000234111 LRRC24Q50LG9 513 aa23.79■■□□□ 1.4
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ODC1-201ENST00000234111 STRN4Q9NRL3 753 aa23.79■■□□□ 1.4
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ODC1-201ENST00000234111 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
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ODC1-201ENST00000234111 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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ODC1-201ENST00000234111 CCDC114Q96M63 670 aa23.74■■□□□ 1.39
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ODC1-201ENST00000234111 STIM2Q9P246 746 aa23.74■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.74■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 ZNF233A6NK53 670 aa23.73■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 CYP27A1Q02318 531 aa23.73■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 PAK1Q13153 545 aa23.73■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.73■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 PARP9Q8IXQ6 854 aa23.73■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 SCLT1Q96NL6 688 aa23.73■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 PSMB7Q99436 277 aa23.73■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 EHD2Q9NZN4 543 aa23.73■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 RWDD2AQ9UIY3 292 aa23.73■■□□□ 1.39
ODC1-201ENST00000234111 FAM205CA6NFA0 338 aa23.73■■□□□ 1.39
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