RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYH1P12882 1939 aa22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ERCC3P19447 782 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SHMT1P34896 483 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COG2Q14746 738 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBE3CQ15386 1083 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COBLO75128 1261 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GUCY1A2P33402 732 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TLE2Q04725 743 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SEPT2Q15019 361 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHGBP05060 677 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLS1Q14651 629 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LCORLQ8N3X6 602 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARMT1Q9H993 441 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EYSQ5T1H1 3165 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MBD4O95243 580 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLCD1P51178 756 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDE1AP54750 535 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A0A1W2PRG0 241 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLTBP09497 229 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NUCB1Q02818 461 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MB21D1Q8N884 522 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MROH8Q9H579 483 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PHF24Q9UPV7 400 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ITGB8P26012 769 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAML3Q96JK9 1138 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RARBP10826 455 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RAG1P15918 1043 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EPHB4P54760 987 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FSD1Q9BTV5 496 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FLOT1O75955 427 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DSG3P32926 999 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF180Q86T96 592 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 APPBP2Q92624 585 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDH23Q9H251 3354 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRKAB2O43741 272 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FCER1AP12319 257 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FPGSQ05932 587 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GABPAQ06546 454 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRIN2CQ14957 1233 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATG4CQ96DT6 458 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIAA0355O15063 1070 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PGK1P00558 417 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DNAJB2P25686 324 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP38Q8NB14 1042 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OSBP2Q969R2 916 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EVX2Q03828 476 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EVI5LQ96CN4 794 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A0A1W2PQY0 241 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNFRSF10AO00220 468 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COL9A1P20849 921 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MMP19Q99542 508 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC25A27O95847 323 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PGK2P07205 417 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF576Q9H609 170 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.58■■□□□ 1.21
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