RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C CDC1P40986 491 aa5.18□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C NET1P47035 1189 aa5.18□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C GTR1Q00582 310 aa5.18□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C GET3Q12154 354 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C IRC20Q06554 1556 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C CAT8P39113 1433 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TPK1P06244 397 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C YMR085WP0CF18 432 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-FP0CX61 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-GR2P0CX62 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-CP25383 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C ECM32P32644 1121 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C YIL161WP40449 235 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C PSP1P50896 841 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C YPR003CP53394 754 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C ADE16P54113 591 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-DR2Q03483 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C THI3Q07471 609 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-BQ12260 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C CRC1Q12289 327 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-OR2Q12293 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-DR1Q12392 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-OR1Q12439 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C TY2A-DR3Q99303 438 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C NUP159P40477 1460 aa5.17□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C COQ3P27680 312 aa5.16□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C ASE1P50275 885 aa5.16□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C ORC5P50874 479 aa5.16□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C COG1P53079 417 aa5.16□□□□□ -1.58
PFA4YOL003C CFD1P40558 293 aa5.15□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C COP1P53622 1201 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C STP1Q00947 519 aa5.15□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C GDB1Q06625 1536 aa5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C SNF1P06782 633 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YAP1P19880 650 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C SRP54P20424 541 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C TRX2P22803 104 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C RAD16P31244 790 aa5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C ARN1P38731 627 aa5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YJL107CP42947 387 aa5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C DCP2P53550 970 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C VID22Q05934 901 aa5.14□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C TPA1P40032 644 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C ASG1P40467 964 aa5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YIL024CP40543 189 aa5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C IST3P40565 148 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C SWA2Q06677 668 aa5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C TMA16Q08687 178 aa5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C AFT2Q08957 416 aa5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C TRM8Q12009 286 aa5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C SRB8P25648 1427 aa5.13□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C PDR10P51533 1564 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C SPO14P36126 1683 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YRF1-1P0CX20 1796 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YRF1-5P0CX21 1796 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YRF1-8P0CX22 1796 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C GAL4P04386 881 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YER190C-BP0CX94 160 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YEL077W-AP0CX95 160 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YGR296C-BP0CX96 160 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YPL283W-BP0CX97 160 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YPR204C-AP0CX98 160 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C TEF4P36008 412 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C EAF7P53911 425 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YML131WQ03102 365 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C PFA4Q12006 378 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C VCX1Q99385 411 aa5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C DPB3P27344 201 aa5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C MSS51P32335 436 aa5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C SRB5P32585 307 aa5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C OCT1P35999 772 aa5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C AAP1P37898 856 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C UME6P39001 836 aa5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C IML2P47031 731 aa5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C VTC3Q02725 835 aa5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C CRN1Q06440 651 aa5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C BUD3P25558 1636 aa5.11□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data5.1□□□□□ -1.59not detected
PFA4YOL003C TFC3P34111 1160 aa5.1□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C TOM71P38825 639 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C MNT3P40549 630 aa5.1□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C RPN11P43588 306 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C VPS4P52917 437 aa5.1□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C PDR12Q02785 1511 aa5.1□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C PDR8Q06149 701 aa5.1□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C PIG1Q06216 648 aa5.1□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C YPT1P01123 206 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C SUI3P09064 285 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C CNA1P23287 553 aa5.09□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C RPT3P33298 428 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C SLC1P33333 303 aa5.09□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C NTR2P36118 322 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C ADE17P38009 592 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C AXL2P38928 823 aa5.09□□□□□ -1.59
PFA4YOL003C PSD1P39006 500 aa5.09□□□□□ -1.59
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