RNA–Protein interactions for RNA: YLR408C

BLS1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLS1, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLS1	YLR408C	UBP13	P38187	747 aa		5	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	VPS41	P38959	992 aa		5	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	VTC3	Q02725	835 aa		5	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	YLR455W	Q06188	304 aa		5	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	MRP20	P32387	263 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	MRX1	P40050	688 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	FMP10	P40098	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	YIL024C	P40543	189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	SIP4	P46954	829 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	MEP3	P53390	489 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	MUB1	Q03162	620 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	MCH4	Q08268	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	PFA4	Q12006	378 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	CNA1	P23287	553 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	CBK1	P53894	756 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	STP1	Q00947	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	RSM28	Q03430	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	CHO1	P08456	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	PET111	P08468	800 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	GPA1	P08539	472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	CDC15	P27636	974 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	MCM10	P32354	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	LHS1	P36016	881 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	IME4	P41833	600 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	CTK2	P46962	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	NBP2	Q12163	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	RRI1	Q12468	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLS1	YLR408C	STE50	P25344	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YCR006C	P25350	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	ECM10	P39987	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	JHD1	P40034	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	VID27	P40157	782 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	SLZ1	P40167	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	MNT3	P40549	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	INN1	P53901	409 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	INA17	Q02888	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	SWF1	Q04629	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	PXL1	P36166	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YJR061W	P40355	935 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	AAD10	P47182	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	FCP1	Q03254	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	AFT2	Q08957	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YPR089W	O13585	888 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	ALY1	P36117	915 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	SPC97	P38863	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	ASI1	P54074	624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	CAC2	Q04199	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YKU80	Q04437	629 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	FRE3	Q08905	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	ATX2	Q12067	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	NKP1	Q12493	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	PCI8	P40512	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	UBP8	P50102	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	FLO5	P38894	1075 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	PKP1	P40530	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	GEP3	Q08622	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	MGM1	P32266	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	ASK1	P35734	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	ESL2	P36168	1195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	YFR020W	P43600	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	GLO1	P50107	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	BSC5	P53755	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	PFA5	Q03289	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	ATG9	Q12142	997 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLS1	YLR408C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BLS1	YLR408C	CLB2	P24869	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLS1	YLR408C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BLS1	YLR408C	LEU5	P38702	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLS1	YLR408C	UIP3	P39547	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLS1	YLR408C	SMC3	P47037	1230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLS1	YLR408C	YPT11	P48559	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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