RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	PIF1	P07271	859 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	MSS18	P08593	268 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	RAD24	P32641	659 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	GEX2	P36173	615 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	DJP1	P40564	432 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	YTP1	P53584	459 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	TAH18	Q12181	623 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	HIS6	P40545	261 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	YNL181W	P53878	407 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	MCP2	Q06567	569 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	YOL159C	Q08300	171 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	BAG7	Q12128	409 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	GAL1	P04385	528 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	TRS65	P32893	560 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	PUG1	P40100	303 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	ATG27	P46989	271 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	CUL3	P53202	744 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	MET14	Q02196	202 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	YLR281C	Q05863	155 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	CRN1	Q06440	651 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	PCD1	Q12524	340 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	CSR2	Q12734	1121 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	YML002W	P0CF17	737 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	SDS24	P38314	527 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	PHM8	P40025	321 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	AZF1	P41696	914 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	SWP82	P43554	623 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	FET5	P43561	622 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	IMA1	P53051	589 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	MAK10	Q02197	733 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	DAP1	Q12091	152 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	SWT1	Q12104	458 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	CLB4	P24871	460 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	YPK3	P38070	525 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	YIL060W	P40519	144 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	RTS2	P40962	232 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	YFR020W	P43600	232 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	CRZ1	P53968	678 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKL063C	YKL063C	BIK1	P11709	440 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	GLN3	P18494	730 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	MSH1	P25846	959 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	STV1	P37296	890 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	YBR139W	P38109	508 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	RIM2	P38127	377 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	YJL070C	P40361	888 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	TRS130	Q03660	1102 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	ATG23	Q06671	453 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	VAM6	Q07468	1049 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	YDL218W	Q07629	317 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	RAP1	P11938	827 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	SAN1	P22470	610 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	YKL133C	P36066	463 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	ARP10	Q04549	284 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	COX17	Q12287	69 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	PMS1	P14242	873 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	LHS1	P36016	881 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	CTK2	P46962	323 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	PKP2	P53170	491 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	MLC2	Q06580	163 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	ECM10	P39987	644 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	RSM28	Q03430	361 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	TMA16	Q08687	178 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	RPB8	P20436	146 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	CLB2	P24869	491 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	ATS1	P31386	333 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	MRX1	P40050	688 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	COG1	P53079	417 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	NUP100	Q02629	959 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	RSF1	Q05043	376 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	MRS3	P10566	314 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKL063C	YKL063C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.6 ms