RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	RTT101	P47050	842 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	MRX6	P48564	524 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SIW14	P53965	281 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	BCP1	Q06338	283 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SWC7	Q06707	132 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SLD7	Q08457	257 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	BUD7	Q08754	746 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YIG1	Q08956	461 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	GET4	Q12125	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
KAR2	YJL034W	SVS1	Q12254	260 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	NTO1	Q12311	748 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	HRT3	Q12347	344 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	WHI5	Q12416	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	URA4	P20051	364 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	CLB2	P24869	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	VAC17	P25591	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
KAR2	YJL034W	DGR2	P32330	852 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	UIP5	P36137	443 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ATG12	P38316	186 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SLX1	P38324	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YHR182W	P38870	785 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SHU2	P38957	223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
KAR2	YJL034W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	CNN1	P43618	361 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	NUP84	P52891	726 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	VPS62	P53285	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	CIK1	Q01649	594 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ULP1	Q02724	621 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	APC9	Q12107	265 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	APM4	Q99186	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	RHO2	P06781	192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	DAL1	P32375	460 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SPR1	P32603	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	PEP12	P32854	288 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	MRP21	P38175	177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	VAC8	P39968	578 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ELO3	P40319	345 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YJR061W	P40355	935 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SNG1	P46950	547 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	VPS25	P47142	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	NMA2	P53204	395 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	PEX8	P53248	589 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	GND2	P53319	492 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ASI2	P53895	289 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	CDC14	Q00684	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	MCM21	Q06675	368 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	STB3	Q12427	513 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	COX5A	P00424	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
KAR2	YJL034W	VPS34	P22543	875 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	TPO5	P36029	618 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ECM13	P38195	257 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	CAB2	P40506	365 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	MAM33	P40513	266 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ARH1	P48360	493 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	COG2	P53271	262 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YNL115C	P53925	644 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	EFM6	P53970	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	TRS31	Q03337	283 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YML083C	Q04526	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	SEC10	Q06245	871 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR2	YJL034W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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