RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	LOH1	P47055	219 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NIT3	P49954	291 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SPO19	Q03029	223 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ATG23	Q06671	453 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TRE1	Q08919	783 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	COX17	Q12287	69 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	VPS63	O13549	108 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	BEM1	P29366	551 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DGR2	P32330	852 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NUD1	P32336	851 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	VPS51	P36116	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SHU2	P38957	223 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ALY2	P47029	1046 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	URB2	P47108	1174 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	BET4	Q00618	327 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RNT1	Q02555	471 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NGL3	Q03210	505 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ENT4	Q07872	247 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SLP1	Q12232	587 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MET3	P08536	511 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ADY2	P25613	283 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SSO1	P32867	290 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NUF2	P33895	451 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	EMC3	P36039	253 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YKL071W	P36086	256 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	AIM46	P38885	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	AFG3	P39925	761 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YEL057C	P39983	233 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PHB1	P40961	287 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	AAD14	P42884	376 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	OTU1	P43558	301 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PRM1	P53835	661 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RAD30	Q04049	632 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NMD4	Q12129	218 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MTR10	Q99189	972 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	COB	P00163	385 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RAM1	P22007	431 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	VAC17	P25591	423 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RAD14	P28519	371 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CYM1	P32898	989 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	REC104	P33323	182 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	LHS1	P36016	881 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YKL070W	P36087	169 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PIG2	P40187	538 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PPT1	P53043	513 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MND1	P53102	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	EST2	Q06163	884 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SAM3	Q08986	587 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	AEP3	Q12089	606 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	VID24	P38263	362 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	TAE1	P38340	232 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	JHD1	P40034	492 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SIP4	P46954	829 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YHC3	P47040	408 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YJR124C	P47159	448 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	HNT2	P49775	206 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	TIM21	P53220	239 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YNL143C	P53908	130 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SLT2	Q00772	484 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	GCR2	Q01722	534 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CUR1	Q06469	252 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	THI22	Q06490	572 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	GPN3	Q06543	272 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SYT1	Q06836	1226 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YLL007C	Q07799	665 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	GSH2	Q08220	491 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PTC5	Q12511	572 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YOS9	Q99220	542 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MSF1	P08425	469 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88

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