RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C KAP120Q02932 1032 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PFA5Q03289 374 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C TRM82Q03774 444 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YMR027WQ04371 470 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SPC2Q04969 178 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YDR344CQ05510 147 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CSC1Q06538 782 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YPR091CQ06833 770 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SPO75Q07798 868 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data3.51□□□□□ -1.85not detected
SPT4YGR063C DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C FRE5Q08908 694 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C LDB17Q12342 491 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ERP4Q12450 207 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SPE4Q12455 300 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C NBL1Q3E7Y6 73 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C FOB1O13329 566 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ADE8P04161 214 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GAL1P04385 528 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C THS1P04801 734 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SNF1P06782 633 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ARG82P07250 355 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GCR1P07261 785 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SNF4P12904 322 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C FBA1P14540 359 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C OM45P16547 393 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C NCP1P16603 691 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C AEP2P22136 580 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SAN1P22470 610 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RIT1P23796 513 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PTP2P29461 750 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C NTG1P31378 399 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C THI4P32318 326 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C NUP2P32499 720 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CYS4P32582 507 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YKL133CP36066 463 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
SPT4YGR063C YBL036CP38197 257 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CDS1P38221 457 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C FMP23P38231 175 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CCZ1P38273 704 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C VHC1P38329 1120 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YBR259WP38338 688 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MSG5P38590 489 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ERG7P38604 731 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YHL050CP38721 697 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RIM4P38741 713 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C END3P39013 349 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PHM8P40025 321 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MXR1P40029 184 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YJR061WP40355 935 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C NUP82P40368 713 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C HPM1P40481 377 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C VHR1P40522 640 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C HXT9P40885 567 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MMM1P41800 426 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C THI6P41835 540 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C AGP3P43548 558 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C BST1P43571 1029 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MAD3P47074 515 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C HOC1P47124 396 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C UBC12P52491 188 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C IMA1P53051 589 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RAI1P53063 387 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YGR067CP53243 804 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C DAM1P53267 343 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C HHO1P53551 258 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RCF2P53721 224 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RPN4Q03465 531 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ADI1Q03677 179 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YMR010WQ03687 405 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C UBX5Q06682 500 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ASA1Q06822 443 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PSR2Q07949 397 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RSC58Q07979 502 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YOL075CQ08234 1294 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YNG1Q08465 219 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C FLC1Q08967 793 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YPR022CQ12139 1133 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C DGK1Q12382 290 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YPR1Q12458 312 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MED11Q99278 115 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C COX4P04037 155 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C TPK3P05986 398 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PET54P10834 293 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SIT4P20604 311 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ATG22P25568 528 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C KAR4P25583 335 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RAD27P26793 382 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CAP1P28495 268 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MCM5P29496 775 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GUT2P32191 649 aa3.49□□□□□ -1.85
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