RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W SYT1Q06836 1226 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W TRE2Q08693 809 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SPE4Q12455 300 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RGS2Q99188 309 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SCH9P11792 824 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W DAL81P21657 970 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W BAS1P22035 811 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W KIN3P22209 435 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YSP3P25036 478 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W AAD3P25612 363 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SWE1P32944 819 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W CAB3P36076 571 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RRP14P36080 434 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W HSM3P38348 480 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W GND1P38720 489 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YJL206CP39529 758 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SLX8P40072 274 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PAN6P40459 309 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W ERG10P41338 398 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W VEL1P53058 206 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YTP1P53584 459 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SHE9Q04172 456 aa8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SST2P11972 698 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RBK1P25332 333 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W DCC1P25559 380 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W BEM1P29366 551 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PHO11P35842 467 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PHO89P38361 574 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PHO12P38693 467 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YDR089WP38966 869 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W DOT6P40059 670 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W TES1P41903 349 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W AIM23P47015 356 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W TAF6P53040 516 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W AIM14P53109 570 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SUB1P54000 292 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PET117Q02771 107 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YMR102CQ03177 834 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W VPS16Q03308 798 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W TAF11Q04226 346 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YLR177WQ06251 628 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PER33Q12144 273 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W CCH1P50077 2039 aa8.92□□□□□ -0.98
DDI1YER143W AMD1P15274 810 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PHA2P32452 334 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W COY1P34237 679 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SCD5P34758 872 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W TFA2P36145 328 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W HOS4P40480 1083 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SEC28P40509 296 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W CHS6P40955 746 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PRM1P53835 661 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W EFM6P53970 246 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W ORC3P54790 616 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W AGE1Q04412 482 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YDR109CQ04585 715 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W MCP2Q06567 569 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W FLC1Q08967 793 aa8.91□□□□□ -0.98
DDI1YER143W STE2D6VTK4 431 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W DEP1P31385 405 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W GUT2P32191 649 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W CTF13P35203 478 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W IRS4P36115 615 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YHR182WP38870 785 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RGI2P40188 164 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YJR061WP40355 935 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RMD8P43620 662 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SIP4P46954 829 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W MAD3P47074 515 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W NIS1P53939 407 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SPP2Q02521 185 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YDR131CQ03899 556 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W ADY3Q07732 790 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W FRT1Q99332 602 aa8.9□□□□□ -0.98
DDI1YER143W NSP1P14907 823 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W PHO3P24031 467 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W EMC1P25574 760 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YCR099CP25657 155 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YKL097CP34245 136 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W TOM20P35180 183 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W LRG1P35688 1017 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data8.89□□□□□ -0.99not detected
DDI1YER143W LDB7P38210 180 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W GGA2P38817 585 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W FAR3P46671 204 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W CSN12P47130 423 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YHM2Q04013 314 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YPR114WQ06107 315 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W RSB1Q08417 382 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.7 ms