RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C BUD14P27637 709 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YJU2P28320 278 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C PRE2P30656 287 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C PMT1P33775 817 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C ATG19P35193 415 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C CMC1P36064 111 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C AKR1P39010 764 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C SDP1P40479 209 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YGR012WP53206 393 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C CUZ1P53899 274 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C ADE12P80210 433 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C HMO1Q03973 246 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C MCM21Q06675 368 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C PEX19Q07418 342 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C RRT8Q08219 342 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C UAF30Q08747 228 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YPL272CQ08984 517 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C AIM41Q12032 185 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C UBX3Q12229 455 aa6.69□□□□□ -1.34
SHO1YER118C GAL7P08431 366 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C ARO3P14843 370 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C ERG6P25087 383 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C WHI3P34761 661 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C GEX2P36173 615 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C TAT1P38085 619 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C THI2P38141 450 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C DED81P38707 554 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data6.68□□□□□ -1.34not detected
SHO1YER118C FTR1P40088 404 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C SEC9P40357 651 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C IME4P41833 600 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C PET130P47065 347 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C RAD17P48581 401 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C COX18P53239 316 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C TWF1P53250 332 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C DCP2P53550 970 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C RHO5P53879 331 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C ECM18Q04623 453 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C MSC3Q05812 728 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa6.68□□□□□ -1.34
SHO1YER118C AFG1P32317 509 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C SPC110P32380 944 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C MRP4P32902 394 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YHL017WP38745 532 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C NUP60P39705 539 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C APT1P49435 187 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C LSC1P53598 329 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C AQR1P53943 586 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C ABZ2Q03266 374 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C PPM1Q04081 328 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C VTA1Q06263 330 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C VPS54Q12071 889 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C AVL9Q12500 764 aa6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C PNO1Q99216 274 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHO1YER118C GAL80P04387 435 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C SEC12P11655 471 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C TAL1P15019 335 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C TUP1P16649 713 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C KIN82P25341 720 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YIH1P25637 258 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C CRM1P30822 1084 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C SLM4P38247 162 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C RFC5P38251 354 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C EHT1P38295 451 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C HXT14P42833 540 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C CTK2P46962 323 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C MRPL1Q04599 285 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C TRE1Q08919 783 aa6.66□□□□□ -1.34
SHO1YER118C LPD1P09624 499 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C RPL3P14126 387 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C PDC5P16467 563 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C DMC1P25453 334 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C APL1P27351 700 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C MRE11P32829 692 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YME2P32843 850 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C SEC66P33754 206 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C APT2P36973 181 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C ALG14P38242 237 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C MAF1P41910 395 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C INP52P50942 1183 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C VID30P53076 958 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YGR130CP53278 816 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C ASI2P53895 289 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C MSC2Q03455 724 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C BUD22Q04347 519 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C RBS1Q05672 457 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C POM34Q12445 299 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C NBL1Q3E7Y6 73 aa6.65□□□□□ -1.34
SHO1YER118C YBR085C-AO43137 85 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C RNR1P21524 888 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C URK1P27515 501 aa6.64□□□□□ -1.35
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