RNA–Protein interactions for RNA: YER068W

MOT2, Transcript of Ubiquitin-protein ligase subunit of the CCR4-NOT complex, yeast

Gene MOT2, Length 1,764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MOT2	YER068W	APS3	P47064	194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	BUD9	P53226	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	SPO1	P53541	631 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	VPS75	P53853	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	ADA2	Q02336	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	VPS64	Q03944	604 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	MGR3	Q04472	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	MCP2	Q06567	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	CAT8	P39113	1433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	RSR1	P13856	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	PRE8	P23639	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	SED4	P25365	1065 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	POL4	P25615	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	ATO2	P32907	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	PTC7	P38797	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	VFA1	P40080	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	RCO1	Q04779	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	ADY4	Q05955	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	VPS36	Q06696	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	RTN2	Q12443	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	HIR3	P47171	1648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	PMA2	P19657	947 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	KIN82	P25341	720 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	AAD3	P25612	363 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	RPC34	P32910	317 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	GTS1	P40956	396 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	SHE10	P53075	577 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	COG1	P53079	417 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	HST1	P53685	503 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	NSG2	P53898	299 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	ZDS2	P54786	942 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	SEC5	P89102	971 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	YSA1	Q01976	231 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	ADY3	Q07732	790 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.61	not detected
MOT2	YER068W	MLH2	Q07980	695 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	CTI6	Q08923	506 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	NMD4	Q12129	218 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	ISA2	Q12425	185 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	PCD1	Q12524	340 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MOT2	YER068W	YLR415C	O13578	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	MRP20	P32387	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ORC2	P32833	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	RIB7	P33312	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	RSM22	P36056	628 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	YBL029W	P38201	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	FLC2	P39719	783 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	YJL068C	P40363	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	SPO22	P40511	975 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	MPS2	P53159	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	COX18	P53239	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	FDC1	Q03034	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	TRS31	Q03337	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	TAF12	Q03761	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ARP9	Q05123	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	DON1	Q05610	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	YLH47	Q06493	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
MOT2	YER068W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	AIM41	Q12032	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	RCN2	Q12044	265 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	UPC2	Q12151	913 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	SWM1	Q12379	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ITR2	P30606	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	MAC1	P35192	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	YKL063C	P35725	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	YSW1	P38280	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	IPI3	P53877	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	FAR8	Q05040	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	BUG1	Q12191	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	MED4	Q12343	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	SNF2	P22082	1703 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ATG2	P53855	1592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	CTT1	P06115	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	PDE2	P06776	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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