RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	COG1	P53079	417 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	YDR132C	Q03900	495 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	HIS5	P07172	385 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	AMD2	P22580	549 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	MSH2	P25847	964 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	HEM3	P28789	327 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	PHA2	P32452	334 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	PHO89	P38361	574 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	ACO2	P39533	789 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	FAR3	P46671	204 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	MNT2	P53059	558 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	SPC105	P53148	917 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YNL143C	P53908	130 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YOL036W	Q08206	761 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	SPE4	Q12455	300 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	RMD5	Q12508	421 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	MSF1	P08425	469 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YMR085W	P0CF18	432 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YJU3	P28321	313 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YHR182W	P38870	785 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	MNN1	P39106	762 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	ALG8	P40351	577 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	TAF6	P53040	516 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	EMC4	P53073	190 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	VAC7	P53950	1165 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	MPD2	Q99316	277 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YCR099C	P25657	155 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	RRN3	P36070	627 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YJR061W	P40355	935 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	CSN9	Q03981	162 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	SHE9	Q04172	456 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	NSE1	Q07913	336 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	STE2	D6VTK4	431 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	FUS1	P11710	512 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	GUT2	P32191	649 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	RIM2	P38127	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	LDB7	P38210	180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YBR259W	P38338	688 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	HAT2	P39984	401 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	MGS1	P40151	587 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	OSW5	P40219	148 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	GLG2	P47011	380 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	RCF2	P53721	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	PPN1	Q04119	674 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	CRN1	Q06440	651 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	NUS1	Q12063	375 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YOR338W	Q99326	363 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	COX6	P00427	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	ABF1	P14164	731 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	SEC63	P14906	663 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	MRE11	P32829	692 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	ASK1	P35734	292 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	PHO11	P35842	467 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	STB6	P36085	766 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YSW1	P38280	609 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	PHO12	P38693	467 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	ATH1	P48016	1211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YNL058C	P53947	316 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.16	□□□□□ -0.62	not detected
RNQ1	YCL028W	NUT2	Q06213	157 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	APC9	Q12107	265 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	FRT1	Q99332	602 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YSC84	P32793	468 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	GTS1	P40956	396 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	NMA2	P53204	395 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YNR061C	P53747	219 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	ARP4	P80428	489 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	YML119W	Q03208	357 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNQ1	YCL028W	SPS1	P08458	490 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	BRF1	P29056	596 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	MRPL9	P31334	269 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	DEP1	P31385	405 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	GUT1	P32190	709 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.5 ms