RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	YKU80	Q04437	629 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	PIG1	Q06216	648 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	MMR1	Q06324	491 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	DAS2	Q12084	232 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TAH18	Q12181	623 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	LHS1	P36016	881 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YBR062C	P38239	180 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TMN3	P40071	706 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	VID27	P40157	782 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YNL320W	P42840	284 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	MDR1	P53258	950 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	MAK10	Q02197	733 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	USA1	Q03714	838 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	STP4	Q07351	490 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	THI73	Q07904	523 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	NCA2	Q12374	616 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	OCA6	Q12454	224 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	ECM4	P36156	370 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	MRPL7	P36519	292 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	FZO1	P38297	855 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SIP3	P38717	1229 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RTS1	P38903	757 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	LYS14	P40971	790 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TDA10	P42938	290 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	PMT3	P47190	753 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YNL144C	P53907	740 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	ECI1	Q05871	280 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SIL1	Q08199	421 aa		4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	ALG1	P16661	449 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TYR1	P20049	452 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SEC15	P22224	910 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	KAR9	P32526	644 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RPC25	P35718	212 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	ERG7	P38604	731 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	INA22	P40576	216 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	URB2	P47108	1174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YIP4	P53093	235 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	FCP1	Q03254	732 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RMT2	Q03305	412 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	OPY2	Q06810	360 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	PSR2	Q07949	397 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SSP2	Q08646	371 aa		4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SWI6	P09959	803 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
POP4	YBR257W	SEC66	P33754	206 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	NUF2	P33895	451 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SRL3	P36167	246 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	MAL31	P38156	614 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RXT2	P38255	430 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SAP185	P40856	1058 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SHE10	P53075	577 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TFC6	Q06339	672 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	MLH2	Q07980	695 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	NKP1	Q12493	238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.68	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	ADH4	P10127	382 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	COQ1	P18900	473 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	REC107	P21651	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YME1	P32795	747 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	CDS1	P38221	457 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RCK2	P38623	610 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TDA11	P38854	504 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	AIM20	P40451	204 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	PCI8	P40512	444 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YNL018C	P53976	612 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66

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