RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	MRX1	P40050	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CTK2	P46962	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	ADA2	Q02336	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	INA17	Q02888	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CRF1	Q04930	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	VPS38	Q05919	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	HIS5	P07172	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	BUD14	P27637	709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	BCS1	P32839	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PMT1	P33775	817 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	THI2	P38141	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	MUP3	P38734	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	ERC1	P38767	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	IMO32	P53219	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PLB2	Q03674	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PEX19	Q07418	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CTF3	Q12748	733 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SWR1	Q05471	1514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	DAP2	P18962	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CMC1	P36064	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PCH2	P38126	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YSW1	P38280	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	OSW5	P40219	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PET130	P47065	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	RFX1	P48743	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SHE4	P51534	789 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	ALF1	P53904	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YLH47	Q06493	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	TRM11	Q12463	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	GAL80	P04387	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YIH1	P25637	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SUR1	P33300	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SEC66	P33754	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	RRT2	P38332	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	BAP3	P41815	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	MAF1	P41910	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	USA1	Q03714	838 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	MGR3	Q04472	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	ATG23	Q06671	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	AVL9	Q12500	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CDC6	P09119	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PRP28	P23394	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	MRE11	P32829	692 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	LTV1	P34078	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	NUP60	P39705	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	TWF1	P53250	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YGR111W	P53265	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	HMI1	Q12039	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SEF1	P34228	1148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	FMO1	P38866	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	REV7	P38927	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	ALT2	P52892	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	DON1	Q05610	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SPH1	Q06160	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	UAF30	Q08747	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	FRE5	Q08908	694 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	TPK2	P06245	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	MRPL7	P36519	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SAF1	P38352	637 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	HXT14	P42833	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CTR1	P49573	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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