RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619252.4

CU633967.1-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU633967.1, Length 549 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-201ENST00000619252 SHMT1P34896 483 aa11.94□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 WDR78Q5VTH9 848 aa11.94□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 GPR153Q6NV75 609 aa11.94□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 FSD1Q9BTV5 496 aa11.94□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 ARMT1Q9H993 441 aa11.94□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 PEX10O60683 326 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 CNMDO75829 334 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 MBD4O95243 580 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 IGHDP01880 384 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 HOXC6P09630 235 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 COL6A1P12109 1028 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 ADD2P35612 726 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 GABPAQ06546 454 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 GRB14Q14449 540 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 Q3C1V9 767 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 LCORLQ8N3X6 602 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SH2D4AQ9H788 454 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SWAP70Q9UH65 585 aa11.93□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 PTPREP23469 700 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 PLCD1P51178 756 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 CCL14Q16627 93 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 TDHQ8IZJ6 230 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 MB21D1Q8N884 522 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 ACER1Q8TDN7 264 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 LTBP2Q14767 1821 aa11.92□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 CHGBP05060 677 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SYN1P17600 705 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 ATP2B2Q01814 1243 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SEPT2Q15019 361 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 LRIT3Q3SXY7 679 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 LHX8Q68G74 356 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 LPAR1Q92633 364 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.91□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 STRNO43815 780 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 NEFLP07196 543 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 GUCY1A2P33402 732 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 PDE1AP54750 535 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 UBE3CQ15386 1083 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SMC5Q8IY18 1101 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 PI4K2BQ8TCG2 481 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 RILPL2Q969X0 211 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 LRCH3Q96II8 777 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC5A4Q9NY91 659 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 BTBD7Q9P203 1132 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.9□□□□□ -0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 DNM1LO00429 736 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 PRKAB2O43741 272 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 APPP05067 770 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 CNGA1P29973 690 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 ICA1Q05084 483 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 COG2Q14746 738 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 OLFML2BQ68BL8 750 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 APPBP2Q92624 585 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC17Q96LX7 622 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 SPATC1LQ9H0A9 340 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 FLRT1Q9NZU1 646 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 MYH4Q9Y623 1939 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.89□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 COL6A3P12111 3177 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 CYBAP13498 195 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 ADORA2AP29274 412 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 NUCB1Q02818 461 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 DPP9Q86TI2 863 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.88□□□□□ -0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms