RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 SWAP70Q9UH65 585 aa23.39■■□□□ 1.33
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TRAF4-216ENST00000586813 MBD4O95243 580 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAF4-216ENST00000586813 HOXC6P09630 235 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAF4-216ENST00000586813 SYN1P17600 705 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAF4-216ENST00000586813 BMP8BP34820 402 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAF4-216ENST00000586813 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.38■■□□□ 1.33
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TRAF4-216ENST00000586813 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.36■■□□□ 1.33
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TRAF4-216ENST00000586813 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.35■■□□□ 1.33
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TRAF4-216ENST00000586813 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.34■■□□□ 1.33
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TRAF4-216ENST00000586813 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.33■■□□□ 1.33
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TRAF4-216ENST00000586813 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.32■■□□□ 1.32
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TRAF4-216ENST00000586813 ADORA2AP29274 412 aa23.32■■□□□ 1.32
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TRAF4-216ENST00000586813 USP17L21D6R901 530 aa23.31■■□□□ 1.32
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TRAF4-216ENST00000586813 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.27■■□□□ 1.32
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TRAF4-216ENST00000586813 GPR153Q6NV75 609 aa23.26■■□□□ 1.31
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TRAF4-216ENST00000586813 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TRAF4-216ENST00000586813 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAF4-216ENST00000586813 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAF4-216ENST00000586813 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAF4-216ENST00000586813 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAF4-216ENST00000586813 MYH4Q9Y623 1939 aa23.25■■□□□ 1.31
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