RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-216ENST00000514472 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 FLRT1Q9NZU1 646 aa26.91■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 STAP2Q9UGK3 403 aa26.91■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 CHGBP05060 677 aa26.9■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.9■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.9■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.9■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.9■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 PFASO15067 1338 aa26.9■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 HOXC6P09630 235 aa26.89■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 GRB14Q14449 540 aa26.89■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 COG2Q14746 738 aa26.89■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 C7orf61Q8IZ16 206 aa26.89■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.89■■□□□ 1.9
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF236Q9UL36 1845 aa26.88■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 SMIM22K7EJ46 135 aa26.88■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 COL6A1P12109 1028 aa26.88■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 UBE3CQ15386 1083 aa26.88■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 C12orf60Q5U649 245 aa26.88■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 WDR78Q5VTH9 848 aa26.88■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.88■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 IGHA2P01877 340 aa26.87■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 GDF15Q99988 308 aa26.87■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.86■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 AKR1B1P15121 316 aa26.86■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 BMP8BP34820 402 aa26.86■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 MFSD14CQ5VZR4 134 aa26.86■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 NPLOC4Q8TAT6 608 aa26.86■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 TMX2Q9Y320 296 aa26.86■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.86■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 USP17L12C9JPN9 530 aa26.85■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 USP17L21D6R901 530 aa26.85■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 CDK8P49336 464 aa26.85■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.85■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 LPAR1Q92633 364 aa26.85■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC17Q96LX7 622 aa26.85■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.85■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.84■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 SPATC1LQ9H0A9 340 aa26.84■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.84■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 DSG3P32926 999 aa26.83■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 ATP2B2Q01814 1243 aa26.83■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 ICA1Q05084 483 aa26.83■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 VCPKMTQ9H867 229 aa26.83■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 COL6A3P12111 3177 aa26.83■■□□□ 1.89
FGFR4-216ENST00000514472 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.82■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 STRNO43815 780 aa26.82■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.82■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 MB21D1Q8N884 522 aa26.82■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 SHCBP1Q8NEM2 672 aa26.82■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.82■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 SYN1P17600 705 aa26.81■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 ADORA2AP29274 412 aa26.81■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 CYP2C19P33261 490 aa26.81■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 CTR9Q6PD62 1173 aa26.81■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.81■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.81■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 SH2D4AQ9H788 454 aa26.81■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 ERCC3P19447 782 aa26.8■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 TRPV1Q8NER1 839 aa26.8■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 FLOT1O75955 427 aa26.79■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 LRRC26Q2I0M4 334 aa26.79■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 OLFML2BQ68BL8 750 aa26.79■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 DPP9Q86TI2 863 aa26.79■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 ATG4CQ96DT6 458 aa26.79■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.79■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.79■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa26.79■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 MSCO60682 206 aa26.78■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 CYBAP13498 195 aa26.78■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 LRCH3Q96II8 777 aa26.78■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 DCTPP1Q9H773 170 aa26.78■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.78■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 COBLO75128 1261 aa26.77■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 CNGA1P29973 690 aa26.77■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 MROH8Q9H579 483 aa26.77■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.77■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 MYH4Q9Y623 1939 aa26.77■■□□□ 1.88
FGFR4-216ENST00000514472 ABRAQ8N0Z2 381 aa26.76■■□□□ 1.87
FGFR4-216ENST00000514472 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.76■■□□□ 1.87
FGFR4-216ENST00000514472 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
FGFR4-216ENST00000514472 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
FGFR4-216ENST00000514472 PLS1Q14651 629 aa26.75■■□□□ 1.87
FGFR4-216ENST00000514472 SBK1Q52WX2 424 aa26.75■■□□□ 1.87
FGFR4-216ENST00000514472 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.74■■□□□ 1.87
FGFR4-216ENST00000514472 TMEM132BQ14DG7 1078 aa26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms