RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
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LMO2-202ENST00000395833 MBD3O95983 291 aa34.08■■■■□ 3.05
LMO2-202ENST00000395833 BRAPQ7Z569 592 aa34.08■■■■□ 3.05
LMO2-202ENST00000395833 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 KIF28PB7ZC32 967 aa34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 ATP2B2Q01814 1243 aa34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 FAM83AQ86UY5 434 aa34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 GPT2Q8TD30 523 aa34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 SPATA32Q96LK8 384 aa34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 CFAP45Q9UL16 551 aa34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 MYH15Q9Y2K3 1946 aa34.07■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 XBP1P17861 261 aa34.06■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP34.06■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 PKN1Q16512 942 aa34.06■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 PIBF1Q8WXW3 757 aa34.06■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 LZTS2Q9BRK4 669 aa34.06■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 TMEM39BQ9GZU3 492 aa34.06■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 KCNJ14Q9UNX9 436 aa34.06■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 GDF11O95390 407 aa34.05■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 TNNI2P48788 182 aa34.05■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 ABCB5Q2M3G0 1257 aa34.05■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 RASGRP2Q7LDG7 609 aa34.05■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 SAMD7Q7Z3H4 446 aa34.05■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
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LMO2-202ENST00000395833 MMP1P03956 469 aa34.04■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 GOLGA8HP0CJ92 632 aa34.04■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 TPRNQ4KMQ1 711 aa34.04■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 ATL3Q6DD88 541 aa34.04■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 UBE2HP62256 183 aa34.03■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 TMEM179Q6ZVK1 233 aa34.03■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 VPS54Q9P1Q0 977 aa34.03■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 USP17L2Q6R6M4 530 aa34.03■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 USP17L5A8MUK1 530 aa34.02■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 KLRF2D3W0D1 207 aa34.02■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 H7C1D1 291 aa34.02■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa34.02■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 KANSL2Q9H9L4 492 aa34.02■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 ELP1O95163 1332 aa34.02■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 TNFAIP1Q13829 316 aa34.01■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 MYSM1Q5VVJ2 828 aa34.01■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 USP28Q96RU2 1077 aa34.01■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 CABP5Q9NP86 173 aa34.01■■■■□ 3.04
LMO2-202ENST00000395833 PDHBP11177 359 aa34■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 SCG2P13521 617 aa34■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 SEPT2Q15019 361 aa34■■■■□ 3.03
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LMO2-202ENST00000395833 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP33.99■■■■□ 3.036e-9■□□□□ 10.9
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LMO2-202ENST00000395833 CDAN1Q8IWY9 1227 aa33.99■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 GPC2Q8N158 579 aa33.99■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 NYAP2Q9P242 653 aa33.99■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 GH2P01242 217 aa33.98■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 EEF2P13639 858 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP33.98■■■■□ 3.03
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LMO2-202ENST00000395833 ASPRV1Q53RT3 343 aa33.98■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 RNF181Q9P0P0 153 aa33.98■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 SBF1O95248 1867 aa33.98■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 MYH4Q9Y623 1939 aa33.98■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 SLC35G1Q2M3R5 365 aa33.97■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 SPZ1Q9BXG8 430 aa33.97■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
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LMO2-202ENST00000395833 BTBD18B2RXH4 712 aa33.96■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 SHISA4Q96DD7 197 aa33.96■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
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LMO2-202ENST00000395833 TBC1D12O60347 775 aa33.96■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 PHF20Q9BVI0 1012 aa33.96■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 CPVLQ9H3G5 476 aa33.96■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 HACL1Q9UJ83 578 aa33.96■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa33.95■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 SNHG28P0DPA3 235 aa33.95■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 MIGA2Q7L4E1 593 aa33.95■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 BRMS1Q9HCU9 246 aa33.95■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 GPRC5DQ9NZD1 345 aa33.95■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 PGAP2Q9UHJ9 254 aa33.95■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 RCOR1Q9UKL0 485 aa33.95■■■■□ 3.03
LMO2-202ENST00000395833 KRT2P35908 639 aa33.94■■■■□ 3.02
LMO2-202ENST00000395833 JAG1P78504 1218 aa33.94■■■■□ 3.02
LMO2-202ENST00000395833 CCDC96Q2M329 555 aa33.94■■■■□ 3.02
LMO2-202ENST00000395833 NOSTRINQ8IVI9 506 aa33.94■■■■□ 3.02
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