RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.58■■□□□ 1.52
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UBE2E3-201ENST00000392415 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.58■■□□□ 1.52
UBE2E3-201ENST00000392415 NAPBQ9H115 298 aa24.58■■□□□ 1.52
UBE2E3-201ENST00000392415 VCPKMTQ9H867 229 aa24.58■■□□□ 1.52
UBE2E3-201ENST00000392415 GJD2Q9UKL4 321 aa24.58■■□□□ 1.52
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UBE2E3-201ENST00000392415 GPR142Q7Z601 462 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-201ENST00000392415 GOPCQ9HD26 462 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-201ENST00000392415 NYAP2Q9P242 653 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-201ENST00000392415 PARP14Q460N5 1801 aa24.51■■□□□ 1.51
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UBE2E3-201ENST00000392415 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.51■■□□□ 1.51
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UBE2E3-201ENST00000392415 RNF208Q9H0X6 261 aa24.5■■□□□ 1.51
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 MB21D1Q8N884 522 aa24.49■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.49■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.48■■□□□ 1.51
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UBE2E3-201ENST00000392415 CYP2B6P20813 491 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 MKL1Q969V6 931 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP95Q96GE4 821 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
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UBE2E3-201ENST00000392415 GJA8P48165 433 aa24.47■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.47■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 F5H6K3 240 aa24.46■■□□□ 1.51
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UBE2E3-201ENST00000392415 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 KLRC3Q07444 240 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SHISA4Q96DD7 197 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ATG4CQ96DT6 458 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ZMYM6O95789 1325 aa24.45■■□□□ 1.51
UBE2E3-201ENST00000392415 TTLL1O95922 423 aa24.45■■□□□ 1.5
UBE2E3-201ENST00000392415 FGRP09769 529 aa24.45■■□□□ 1.5
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPREP23469 700 aa24.45■■□□□ 1.5
UBE2E3-201ENST00000392415 RGS2P41220 211 aa24.45■■□□□ 1.5
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.45■■□□□ 1.5
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